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Poste chercheur Post-Doc (H/F) en écologie microbienne et métabolomique des interactions bactéries-pla

Référence : UMR5557-BEABIG-038

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 69622 VILLEURBANNE (France)
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Date limite de candidature : 03/05/2025

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat

    CDD d'1 an

  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels à partir de 3021€ brut mensuel selon expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Le jeune chercheur (H/F) sera intégré(e) au sein de l’équipe Rhizo du laboratoire d’Ecologie Microbienne de Lyon. Il/elle travaillera en étroite collaboration avec C. Prigent-Combaret, DR CNRS, coordinatrice d’un projet innovant ‘SensOrCol’, soutenu par le programme de prématuration du CNRS, et avec les membres de la plateforme du Centre d’Etude des Substances Naturelles (CESN). Il/elle aura à (i) développer une méthode de criblage haut-débit du comportement de cultivars de colza face à Phelipanche ramosa, et (ii) identifier les mécanismes moléculaires mis en jeu dans l’interaction entre différents cultivars de colza utilisés en France et une bactérie phytobénéfique. Des approches de métabolomique sur les différents partenaires d’interaction seront utilisées pour identifier le dialogue moléculaire impliqué dans l’interaction bactérie phytobénéfique / colza / P. ramosa. Les niveaux de colonisation de la rhizosphère des colzas par une souche phytobénéfique seront comparés comme décrit dans une étude précédente (Valente et al. 2020 Plant Cell Environ 43:246).
Activités :
Les principales activités concerneront :
- l’identification des cultivars de colza à inclure dans l’étude et l’obtention de ces cultivars auprès des producteurs de semences de colza
-la mise en place de cultures, en parallèle, d’un grand nombre de cultivars de colza en chambre climatique
-le criblage haut-débit des interactions colza-bactérie phytobénéfique et la comparaison des niveaux de colonisation des colzas par une bactérie phytobénéfique
-l’analyse ciblée des réponses métabolomiques des colzas à la bactérie phytobénéfique après avoir standardisé une méthode UPLC-QToF, sensible et robuste, sur la plateforme CESN du laboratoire d’Ecologie Microbienne
-le traitement statistique des données et la présentation des résultats

Contexte de travail :
Le Laboratoire d'Écologie Microbienne (LEM) du CNRS à Lyon est un centre de recherche internationalement reconnu pour ses travaux à l’interface entre science et innovation, portant sur l'étude des interactions complexes entre les micro-organismes et leur environnement.
Au LEM, nous explorons les mécanismes fondamentaux des interactions microbiennes, de l'échelle moléculaire à celle de l'écosystème. Nos recherches répondent à des enjeux sociétaux majeurs, tels que le changement climatique, la résistance aux antibiotiques, la bioremédiation des sols et des eaux, ainsi que la protection agro-écologique des cultures.

Nous vous proposons un contrat de 20 mois pour développer un projet innovant soutenu par le programme de prématuration du CNRS pouvant aboutir à un transfert technologique dans le domaine de la protection des cultures.

Nous vous proposons :
• Un environnement de travail stimulant aux contacts des personnels de la recherche
• 44 jours de congés / RTT par an
• Des formations adaptées pour vous accompagner
• Le remboursement partiel des titres de transport (75%)
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...

Profil recherché

Competences :
-Compétences techniques en microbiologie, écologie microbienne et métabolomique avec une bonne connaissance des interactions plante-bactérie et des stratégies de protection biologique des plantes contre les plantes phytoparasites
-Connaissance du métabolisme secondaire des Brassicacées et/ou de l’écologie des plantes phytoparasites de la famille des orobanches serait un plus
-Aisance pour la rédaction de rapports et d’articles scientifiques
-Motivation, assiduité, dynamisme et rigueur
-Curiosité scientifique et créativité
-Capacité à travailler à la fois en autonomie mais également en collaboration au sein d’une équipe dynamique, regroupant un grand nombre de nationalités
-Fort intérêt pour l’innovation dans le domaine de la protection des plantes, la valorisation des travaux de recherche et le transfert technologique.
-Bilingue Anglais-Français

Contraintes et risques :
RAS

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant
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