Technicien-Technicienne en virologie et génomique cliniques - H/F

Au sens large, les objectifs du poste consistent à appuyer les projets de recherche en virologie (équipe VIRAL, UMR IHAP) : assurer un soutien technique, participer aux taches transversales dans l’unité et participer à l’encadrement et la formation des étudiants et stagiaires.
Mission 1 : virologie clinique
·         Réceptionner, reconditionner, enregistrer (barcoding) et stocker les échantillons selon un protocole de qualité défini, tenir un cahier d’expériences, rassembler et analyser les résultats, les mettre en forme et en rendre compte.
·         Réaliser, à partir de protocoles définis, des expériences de préparation et d’analyse utilisant un ensemble de techniques (culture virale sur cellules et in ovo, PCR conventionnelle, temps réel et digitale, électrophorèse sur gel d’agarose, autres techniques de biologie moléculaire…)
·         Actualiser le dossier de protocoles techniques.
·         Consulter et exploiter une documentation technique.

Mission 2 : génomique appliquée à la virologie clinique
·         Mettre en œuvre les méthodes spécifiques de préparation des acides nucléique en vue du séquençage NGS
·         Préparer des banques de séquençage NGS, lancement des essais (« runs ») de séquençage et gestion des consommables de séquençage.
·         Sauvegarde des données de séquençage NGS et premières analyses de contrôle qualité.

Mission 3: formation et encadrement des étudiants et stagiaires
·         Accompagnement de stagiaires et de thésards vétérinaires (thèse d’exercice vétérinaire), résidents des collèges de spécialistes vétérinaires,
·         Accompagnement d’étudiants en stage de master et doctorants en thèse de 3ème cycle), notamment dans le cadre de l’EUR UNITEID.
·         Participer à la formation technique des utilisateurs et des stagiaires (bonnes pratiques de laboratoire, règles d’hygiène et sécurité), en lien avec l’assistante de prévention Hygiène et sécurité de l’UMR IHAP et des assistants de prévention des tutelles ENVT et INRAE.

Mission 4 : appui logistique à l’activité du laboratoire de virologie clinique et de l’UMR IHAP

·         Assurer la surveillance des équipements scientifiques, la maintenance de premier niveau et l’entretien du laboratoire
·         Se former à la mise en œuvre des nouvelles techniques dans le service et initier/accompagner les utilisateurs.
·         Appliquer, en situation de travail, les bonnes pratiques de laboratoire, les règles d’hygiène et de sécurité et celles spécifiques à la manipulation de certains produits.
·         Participer à la gestion des stocks et des commandes
·         Participer activement à la mise à jour du processus qualité du laboratoire.