Un phylum à découvrir et caractériser : les champignons marins H/F

Résumé du projet scientifique :
Le rôle biologique et écologique des champignons marins reste largement inconnu. En tant que décomposeurs, ces organismes marins jouent potentiellement un rôle crucial dans le cycle des nutriments des océans. Ils participent à de nombreuses associations en tant que parasites, saprophytes ou symbiotes mutualistes. Leur étude, à toutes les échelles du vivant, est donc essentielle pour comprendre le fonctionnement des océans et de leurs cycles biogéochimiques, la structure des communautés marines et leur résilience face aux changements actuels. Le lauréat de la CPJ aura pour objectif de créer et conduire une recherche à l’interface entre Écologie et Biologie, visant à explorer les spécificités biologiques, écologiques, évolutives, et fonctionnelles des champignons marins. Il devra donc développer des approches en phylogénétique, génomique, biologie cellulaire, physiologie, écologie et biologie de l’évolution, avec pour but final de mieux cerner pour comprendre leurs rôles écosystémiques.
Résumé du projet d'enseignement :
L’enseignement pourra se faire au sein de l’équipe pédagogique de Sorbonne Université. Il pourra s’inscrire dans les formations professionnalisantes de Roscoff, telles que la licence Pro Bio-industries et Biotechnologies. La lauréate ou le lauréat de la CPJ pourra également conduire son enseignement dans les formations générales, comme le Master Sciences de la mer, le Master Biodiversité, Ecologie et Evolution et le Master Biologie Moléculaire et Cellulaire Parcours Parasitologie Mycologie de Sorbonne Université. Le candidat ou la candidate devra assurer un service annuel de 48 h d’enseignement.
Stratégie de l'établissement :
La présence de champignons dans les environnements marins a longtemps été sous-estimée, en raison de limitations méthodologiques et du manque de recherches dédiées. Si leur rôle dans les écosystèmes terrestres est mieux établi, l’importance de leurs fonctions biologiques et écologiques dans le fonctionnement des écosystèmes marins sont presque totalement méconnues. Les champignons marins sont souvent impliqués dans des associations symbiotiques (mutualistes ou parasites) avec du plancton (végétal ou animal), des macroalgues et des animaux et ont un rôle majeur dans la décomposition de la matière organique. Ils agissent comme antagonistes à la croissance de leurs hôtes, lorsqu’ils sont pathogènes, ou sont bénéfiques à leur développement s’ils favorisent la captation des nutriments ou la défense aux stress via leur métabolisme spécialisé. Certains ont la capacité à dégrader efficacement la matière organique dont la paroi des algues. Ainsi, bien qu’ils soient considérés depuis peu comme des acteurs clés dans les cycles biogéochimiques marins, ce groupe reste une des frontières du vivant à explorer. Le CNRS, organisme national de recherche multidisciplinaire, met l'excellence scientifique au service de l'avancée du front de la connaissance conduisant à des innovations au service de la société. Les océans qui couvrent 70% de notre planète, sont aujourd’hui en péril. En France, ils sont étudiés via plusieurs stations marines, plus de cinquante laboratoires et de grands programmes de recherche interdisciplinaires (PPR et PEPR) : le CNRS s’est donc fixé pour objectif stratégique de mieux comprendre les milieux marins pour mieux les protéger. Dans ce contexte, la CPJ ChamP-MER développera un projet de recherche à l’interface entre Écologie et Biologie autour de l’étude des champignons marins, visant à explorer leurs spécificités écologiques, évolutives, génomiques et fonctionnelles afin de mieux comprendre leurs rôles et leur importance dans ces environnements complexes.
Stragtégie du Laboratoire :
L’UMR Adaptation et Diversité en Milieu Marin (AD2M) étudie les espèces et les communautés des océans, leur fonctionnement, leur diversité et leur devenir. Pour cela, AD2M décrit la biodiversité marine et les processus évolutifs qui la sous-tendent, et établit comment ces espèces interagissent, s’adaptent ou modulent leurs environnements. L’UMR Biologie Intégrative des Modèles marins (LBI2M) étudie les métazoaires, macroalgues et microorganismes marins associés. Ceux-ci offrent des perspectives nouvelles pour comprendre l'évolution des processus biologiques, via des approches de génomique fonctionnelle et comparative, métagénomique, génétique, biologie fonctionnelle et structurale. La CPJ s’inscrira dans la stratégie de rapprochement des deux UMR via un sujet à l’interface entre Écologie et Biologie, autour d’un phylum méconnu et pourtant d’importance cruciale dans les océans. Cette nouvelle thématique renforcera le rôle de leader international de la SBR de Roscoff.