Virologue spécialisé en biocontrôle par baculovirus F/H

Vous utiliserez également le plateau de biologie moléculaire de INRAE d’Avignon pour identifier de nouveaux marqueurs génétiques de la résistance aux baculovirus.
Vous serez garant-e du respect des principes et règles d’hygiène et de sécurité, en tenant compte des contraintes spécifiques liées à la manipulation d’insectes et de baculovirus. Vous assurerez une veille scientifique et technologique dans les domaines de la biologie des baculovirus et de leur utilisation en biocontrôle. Enfin, vous participerez à la diffusion et à la valorisation des résultats sous forme de présentations orales et de publications.
Vous gérerez le laboratoire de virologie des insectes de l’unité. Vous serez en charge de la conservation et de l’enrichissement de la collection de baculovirus de l’unité. Pour cela, vous superviserez l’isolement, la production et la caractérisation de baculovirus d’intérêt agronomique.
Vous pourriez être amené-e à rechercher des insectes malades sur le terrain afin d’isoler de nouveaux baculovirus et d’enrichir notre collection.
Côté insectes hôtes, vous serez en charge de la supervision des productions de lignées d’insectes sensibles ou résistants à différents variants viraux, en encadrant directement un-e technicien-ne spécialisé-e dans ce domaine. Ces lignées seront sélectionnées en collaboration avec les scientifiques responsables, à partir de populations prélevées sur le terrain et phénotypées au laboratoire.
À partir de nos collections de virus et de lignées d’hôtes, vous aurez en charge la mise au point de tests biologiques pour caractériser les interactions virus-virus et virus-insecte, dans l’objectif de mieux comprendre l’impact de la diversité génétique virale sur le succès et la durabilité de l’utilisation des baculovirus en agriculture.
Les recherches que vous aurez à mener impliquent l’utilisation de méthodes moléculaires pour détecter et identifier les variants viraux. Vous serez donc amené-e à réaliser des manipulations de biologie moléculaire classique (extraction d’ADN, d’ARN, PCR, ddPCR…) ou en haut débit de type NGS (RNAseq, DNAseq…), en collaboration avec un-e ingénieur-e d’étude au Laboratoire de Biologie Moléculaire (LBM) d’Avignon.
Côté insectes, vous aurez en charge la mise au point de marqueurs moléculaires des résistances aux baculovirus, nécessaires pour la surveillance de ces résistances en appui aux programmes de recherche visant à comprendre la dynamique spatio-temporelle des résistances en lien avec le paysage et les pratique