Bioinformaticien.ne pour l’analyse de données omiques multi espèces

Vous rejoindrez l’équipe GENESIS (Mécanismes génétiques et épigénétiques de la genèse des phénotypes) du laboratoire GenPhySE d'INRAE (UMR 1388), qui a pour thématique majeure la caractérisation des causes moléculaires de la variabilité des caractères chez les animaux domestiques. L'équipe est constituée de 8 chercheurs et 6 ingénieurs et techniciens, et accueille des stagiaires et doctorants (plusieurs thèses en cours).

Pour ce poste, vous prendrez part au projet ANR FeedSeq (https://anr.fr/Project-ANR-22-CE20-0040), visant à caractériser les mécanismes biologiques en lien avec l'efficacité alimentaire. Ce caractère est particulièrement d'intérêt dans le contexte actuel d'évolution de la production animale vers des pratiques plus durables puisqu’il permettrait à terme de limiter la production de ressources nécessaires à l’alimentation animale et les déchets qu’ils produisent. Dans ce cadre vous contribuerez à l’analyse de données omiques multiples : génomiques, épigénomiques et transcriptomiques obtenues dans l’espèce porcine. Ces données seront intégrées en utilisant des outils classiques tels que MixOmics ou MOFA. Vous explorerez aussi le potentiel d’utilisation d’outils alternatifs récents, identifiés par une analyse bibliographique. Puis, en lien avec les chercheurs du projet vous contribuerez à une intégration à plus large échelle, au travers d’autres espèces d’intérêt, en première instance le lapin mais aussi d’autres espèces d’élevage telles que les ruminants, afin d’affiner et décortiquer les mécanismes moléculaires impliqués dans la variabilité de ce caractère agronomique important.