CDD Post-Doctorant Autophagie Stress et Développement H/F

Missions :
Les êtres vivants sont constamment soumis à des variations environnementales, telles que la température, qui peuvent induire un stress et entraîner des dysfonctionnements physiologiques. La mise en œuvre de stratégies préventives et/ou curatives pertinentes nécessite d’améliorer les connaissances sur la régulation des systèmes d’adaptation au stress, ainsi que de développer des stratégies diagnostiques intégrant les niveaux de réponse adaptative et les capacités de résilience des individus.
Les progrès technologiques en matière d’imagerie, de séquençage et d’analyse des données nous permettent d’étudier les réponses au stress et leurs effets sur l’adaptation chez des modèles animaux tels que le nématode C. elegans. Notre équipe a récemment mis au point un modèle de stress thermique aigu et non létal chez C. elegans afin de caractériser la réponse adaptative au niveau individuel (1, 2). Ce stress donne naissance à deux populations de vers présentant des caractéristiques distinctes en termes de croissance, de fertilité et de longévité (3).
Ce projet vise à identifier le réseau de régulation génétique et à caractériser les mécanismes sous-jacents à la variabilité individuelle dans l’adaptation au stress, ainsi que les effets qui en découlent sur la santé. S’appuyant principalement sur des analyses transcriptomiques chez C. elegans, notamment le séquençage d’ARN sur cellules uniques (single nucleus RNA-Seq), le projet combinera des travaux expérimentaux sur C. elegans et leur analyses bioinformatiques. Le chercheur postdoctoral bénéficiera des plateformes de séquençage et de bio-informatique de l’I2BC.

1) Chen, Y., Leboutet, R., Largeau, C., Zentout, S., Lefebvre, C., Delahodde, A., Culetto, E., & Legouis, R. (2021). Autophagy facilitates mitochondrial rebuilding after acute heat stress via a DRP-1-dependent process. The Journal of Cell Biology, 220(4), e201909139.
2) Serot, C., Scarcelli, V., Pouget, A., Largeau, C., Sagot, A., El-Hachami, K., ... & Legouis, R. (2025). Reticulon-dependent ER-phagy mediates adaptation to heat stress in C. elegans. Current Biology, 35(10), 2365-2378.
3) Serot, C., Kong, D., Largeau, C., Gallopin, M., Lescure, A., & Legouis, R. (In preparation). Analysis of the interindividual variability in response to heat stress identifies two subpopulations and a negative regulator of the autophagy flux in C. elegans.

Activités :
Le chercheur sera en charge de réaliser les expériences de stress thermique sur les souches de C. elegans (contrôles, mutantes et exprimant des marqueurs fluorescents). Il/Elle effectuera l’ensemble des analyses transcriptomiques (RT-qPCR, RNA-Seq, snRNA-Seq), de la préparation des échantillons à l’analyse bioinformatique des données. Il rédigera des documents de synthèses de l’avancement de ses travaux à destination du coordinateur du projet et présentera ses données en réunion d’équipe et au sein du consortium. Il est en charge de la veil
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