Chargé d'études scientifiques - Appui scientifique sur la fonge de France (F/H)
Référence : 2026-2247318
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
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Employeur :
Muséum National d'Histoire Naturelle (MNHN)
MNHN - Localisation : Jardin des Plantes
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Les activités
Le(la) candidat(e) assurera l’enrichissement et la consolidation du référentiel fonge de TAXREF en prenant en charge : (1) la mise à jour du référentiel par l’analyse des données taxonomiques bibliographiques et d’inventaires, et (2) la valorisation de l’herbier national.
En lien avec le réseau national des mycologues, les missions incluent :
- Contribuer activement au réseau des mycologues liés au Fungarium du MNHN ainsi que les spécialistes français et internationaux (échanges, concertation et prise en compte des décisions pour le référentiel)
- Assurer la consolidation nationale de TAXREF-Fonge en recensant tous les noms s’appliquant aux taxons de France via les bases de données naturalistes (GBIF, iNaturalist) et les collections du Fungarium
- Détecter les incohérences taxonomiques : (1) au sein de la fonge métropolitaine au regard de la littérature scientifique récente, (2) à l’échelle nationale en comparaison avec les référentiels internationaux (Index Fungorum, Mycobank), et (3) en concertation avec les réseaux d’experts
- Corriger, fiabiliser et compléter les données nomenclaturales (noms, auteurs, dates), en s’appuyant sur les publications originales et les spécimens du Fungarium
- Contribuer au référentiel de séquences ADN pour la fonge de France via les bases de données internationales (GenBank) et les programmes de recherches en cours, en lien avec le développement du futur référentiel national des séquences génétiques. Centraliser les besoins de séquençage liés aux problématiques taxonomiques et à l’enrichissement du référentiel. Si le (la) candidat(e) souhaite, il y a la possibilité de contribuer à du typage moléculaire (barcoding)
- Mobiliser les référentiels nationaux et internationaux existants afin de renforcer la standardisation, la visibilité et l’interopérabilité des données associées aux collections mycologiques du MNHN (SONNERAT)
- Enrichissement et mise à jour de la base TAXREF via l’application TAXREF-web (ajouts et modifications des noms du référentiel)
- Valoriser les résultats au travers de publications scientifiques, notamment sous forme de data papers et pour tester des hypothèses écologiques
Profil recherché
- Être titulaire d’un diplôme de Master ou d’ingénieur (Bac +5) dans les domaines suivants : biologie, taxonomie, systématique, évolution, biodiversité, écologie, conservation, environnement
- Rigoureu(x)se, sens de l’organisation et autonomie
- Connaissances, idéalement dans les domaines suivants :
- Nomenclature et taxonomie, idéalement de la fonge
- Mycologie
- Maîtriser les outils informatiques dédiés à la gestion des référentiels (systèmes d’information et bases de données relationnelles)
- Bonne maîtrise du logiciel R permettant les analyses statistiques
- Un savoir-faire de biologie moléculaire serait apprécié, mais non nécessaire
- Excellente capacité à travailler en équipe et à interagir avec une diversité d’acteurs
- Aisance rédactionnelle, en particulier pour la rédaction de protocoles et d’articles scientifiques, associée à une forte capacité à communiquer et à valoriser son travail tant en interne qu’en externe
Localisation
Qui sommes-nous ?
Dans le domaine des sciences naturelles et humaines, le Muséum contribue à la production, au développement et au partage des connaissances sur la diversité géologique et biologique de la Terre, sur la diversité des cultures et des sociétés et sur l’histoire de la planète.
Venez rejoindre un établissement chargé d’histoire, engagé dans la société, en pleine évolution, à la renommée nationale et internationale. Riche d’une grande variété de métiers et d’activités, le Muséum vous propose d’intégrer des équipes à taille humaine dans un cadre de travail agréable et un environnement stimulant.
Descriptif du service
TAXREF constitue la référence taxonomique nationale pour les dispositifs réglementaires et la gestion des données relatives aux espèces dans le cadre des politiques publiques (SINP, SIB, etc. ; art. L411-1 du Code de l’environnement). Diffusé librement depuis plus de 20 ans, il a été téléchargé plus de 68 000 fois depuis sa version 3 et sert de socle à la majorité des outils naturalistes nationaux ainsi qu’aux échanges inter-plateformes. Avec environ 85 000 entrées correspondant à 32 000 taxons terminaux, le référentiel de la fonge de France, englobant l’ensemble des champignons, y compris les lichens, représente un enjeu majeur pour la communauté d’acteurs impliqués dans la connaissance et la conservation de la biodiversité.
Les attentes associées à ce référentiel ne se limitent pas à la gestion des données d’occurrence des taxons, elles incluent également : (1) la structuration et la documentation des relations fonctionnelles entre les champignons et les autres organismes, telles que les interactions de symbiose ou de parasitisme avec les plantes ; ainsi que les enjeux sanitaires liés aux infections ou aux intoxications, et (2) l’ intégration des fonctions écosystémiques, comme la décomposition et le recyclage de la matière organique, le rôle dans la résistance et la résilience des forêts face aux changements globaux, ou encore la restauration et dépollution des sols.
Dans ce contexte, les besoins sont importants pour alimenter, consolider et maintenir à jour le référenti
À propos de l'offre
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Venez rejoindre un établissement chargé d’histoire, engagé dans la société, en pleine évolution, à la renommée nationale et internationale. Riche d’une grande variété de métiers et d’activités, le Muséum vous propose d’intégrer des équipes à taille humaine dans un cadre de travail agréable et un environnement stimulant.
Type de contrat : Contrat de projet
Durée : 3 ans (1 an et renouvelable 2 ans)
Lieu : Paris 75005, Jardin des plantes
Rémunération : en fonction du profil du candidat retenu et des grilles de rémunération de l’établissement Indice 400-700, débutant accepté
Date de prise de fonction : au plus tard le 1er Septembre 2026
Avantages :
Remboursement de 50% des frais de transport en commun ou forfait mobilité durable
En fonction du cycle de travail, télétravail possible (1jour/semaine)
Mutuelle d'établissement
Un comité social et une association sportive et culturelle
Accès illimité aux sites de l’établissement avec invités
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Vacant à partir du 01/09/2026
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*Chargée / Chargé des études doctorales*