Chargé de l'analyse bio-informatique des données de génome de microorganismes (H/F)
Référence : UAR3194-SOPVAZ-033
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 35000 RENNES (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD d'1 an
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels A partir de 3143.64 € bruts par mois selon votre expèrience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Au sein de du projet européen Microbes4Climate (M4C) impliquant le CEREEP-Ecotron IdF et ECOBIO. ,vous serez chargé de l’analyse bio-informatique des données de génome de microorganismes produites à partir de cellules uniques pour l’étude des conséquences de stress environnementaux extrêmes sur les microorganismes du sol, une expérimentation réalisée par le CEREEP Ecotron IdF.
Activités :
En tant que Ingénieur de recherche , vos activités sont les suivantes :
• mobiliser un workflow existant préalablement développé pour l’analyse des génomes produits par approche single-cell
• compléter/adapter les développements du workflow existant
• produire des analyses de phylogénomique et de génomique des populations à partir des données mscWGS
• interpréter les données
Contexte de travail :
L’UMR ECOBIO est une unité de recherche du domaine de l’écologie collaborant avec l'UAR 3194 CEREEP-ECOTRON IdF dans le cadre d’un projet Européen Microbes4Climate et qui dispose de compétences dans le domaine de l’analyse de données génomique bactérienne produites par approche single cell.
Le travail s’effectuera en lien étroit entre les 2 structures
Profil recherché
Competences :
Diplômé en génomique microbienne, vous avez une excellente connaissance de l’analyse bio-informatique de données de séquençage WGS à partir de cellules uniques et une expertise dans l’interprétation des variants génomiques (génomique comparative)
Vous savez travailler de manière autonome et avez une capacité d’écoute pour adapter les analyses aux questions de recherche.
Vous maîtrisez les techniques de calcul de scientifique appliquées à la biologie, et êtes microbiologiste de formation initiale.
Vous faites preuve d’ initiative et d’imagination.
Vous êtes reconnu pour vos compétences en bio-informatique et en génomique microbienne.
Contraintes et risques :
Déplacement à prévoir entre Rennes (35) et Saint-Pierre-Lès-Nemours (77).
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
