Chercheur en épidémiologie et modélisation mathématique des maladies infectieuses H/F
Référence : 2024-1529096
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
-
Employeur :
Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
L'Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (INRAE) est un établissement public de recherche. - Localisation : 69280 MARCY L'ETOILE
Partager la page
Veuillez pour partager sur Facebook, Twitter et LinkedIn.
- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
-
Nature du contrat
CDD de 2 ans
- Expérience souhaitée Confirmé
-
Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) A partir de 31350€ € brut/an
- Catégorie Catégorie A+ (Encadrement supérieur - Autres emplois fonctionnels)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Vous serez plus particulièrement en charge de :
- Mettre en place un flux hebdomadaire, voire quotidien, de données issues de la base de données nationale d’identification des bovins en France.
- Utiliser ces données pour développer un outil d’appui aux investigations de foyers permettant la reconstruction de chaines de transmission probables et de l’identification des élevages à risque en temps réel ; l’outil prendra notamment en compte la structure des réseaux de mouvements de bovins, des indicateurs de mortalité et intégrera un modèle mécaniste de transmission des maladies infectieuses entre élevages.
- Evaluer l’efficacité de plusieurs méthodes de reconstruction des chaines de transmission et de classification des élevages à risque, les appliquer à la tuberculose bovine à travers l’analyse rétrospective, et éventuellement prospective, de données épidémiologiques.
- Mise à disposition de cet outil via une interface opérationnelle et facilement mobilisable par les utilisateurs finaux.
Profil recherché
Connaissances souhaitées : Connaissances en analyse des réseaux et en modélisation mathématique des maladies infectieuses, notamment des modèles individu-centrés. Maîtrise de R, SQL et d'un langage de programmation informatique tel que C/C++ ou Python. Maîtrise de l’anglais à l’écrit et à l’oral.
Expérience appréciée : Une expérience pertinente en modélisation des dynamiques d'infection sur les réseaux serait un atout.
Aptitudes recherchées : Capacité à soumettre des publications dans des revues scientifiques, à présenter les résultats de recherche lors de conférences internationales ainsi qu’à des audiences de non-spécialistes, à superviser des étudiants, et à travailler au sein d’une équipe multidisciplinaire.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Spécialités pluriscientifiques, Mathématiques
Compétences attendues
Connaissances souhaitées : Connaissances en analyse des réseaux et en modélisation mathématique des maladies infectieuses, notamment des modèles individu-centrés. Maîtrise de R, SQL et d'un langage de programmation informatique tel que C/C++ ou Python. Maîtrise de l'anglais à l'écrit et à l'oral.
Expérience appréciée : Une expérience pertinente en modélisation des dynamiques d'infection sur les réseaux serait un atout.
Langues
- Anglais Maîtrise
Éléments de candidature
Documents à transmettre
Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire
Personnes à contacter
- Guillaume FOURNIE
- Sophie CARLES
Qui sommes-nous ?
NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE
Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.
Notre Mission ?
Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.
Pour répondre à ces grands enjeux mondiaux, nous avons besoin de renfort dans nos équipes. Des métiers de la recherche aux métiers de l’appui, l’INRAE recrute à tout niveau de diplôme (du CAP/BEP à Bac+8) !
Rejoignez une communauté engagée et agissez pour l’intérêt général !
Descriptif du service
UMR EPIA - EPIdémiologie des maladies Animales et zoonotiques
L’Unité Mixte de Recherche Épidémiologie des maladies animales et zoonotiques (UMR0346 - EPIA) est une UMR INRAE-VetAgro Sup.
Pour prévenir les risques infectieux associés aux changements globaux et favoriser la transition agro-écologique, l’unité étudie, dans les populations animales l’épidémiologie de maladies infectieuses, dont certaines sont transmissibles à l’homme. L’originalité de l’unité est de pouvoir croiser épidémiologie, biologie, écologie et évolution dans une approche intégrée, faisant appel à la modélisation et à l’intelligence artificielle.
L’unité est localisée sur deux sites, l’un sur le Centre INRAE à Theix, l’autre sur le campus vétérinaire de VetAgro Sup à Marcy l’Étoile près de Lyon.
Les recherches de l’UMR portent sur des agents pathogènes et des maladies présentant un intérêt en termes de santé animale ou de santé publique (zoonoses). Elles concernent à la fois des maladies à transmission directe (grippes aviaires, fièvre Q, leptospiroses, Diarrhée Virale Bovine (BVD)…) et des maladies vectorielles (maladie de Lyme, encéphalite à tique (TBE), anaplasmose granulocytaire, fièvre catarrhale ovine). L’UMR travaille également sur l’évolution de la résistance des bactéries aux antibiotiques.
À propos de l'offre
-
Conditions particulières d’activité : Ces activités nécessiteront une collaboration étroite avec le ministère en charge de l’agriculture (DGAL-direction générale de l’alimentation, DRAAF-directions régionales de l’agriculture de l’alimentation et de la forêt, DDecPP-direction départementale en charge de la protection des populations), l’ANSES (Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail) et différents acteurs de la Plateforme d’épidémio-surveillance en santé animale (équipe en appui transversale, équipe d’animation de groupes de travail). Cette collaboration visera à garantir que l'outil développé réponde précisément aux besoins opérationnels des acteurs de terrain et soit intégré efficacement dans les protocoles existants. La participation active à des réunions de coordination, des ateliers de travail et des sessions de formation avec ces partenaires sera essentielle pour le succès du projet.
-
Susceptible d'être vacant à partir du 01/07/2024
-
Chargée / Chargé de coordination d'une mesure incitative en santé sécurité de l'alimentation, santé et protection des végétaux et bien-être animal