Chercheur postdoctoral H/F - Modifications des ARNt et adaptation au stress chez des souches cliniques

Missions :
La personne recrutée aura pour mission d’étudier l’impact des modifications post-transcriptionnelles des ARN de transfert (ARNt) sur la tolérance et l’adaptation au stress de souches cliniques d’Escherichia coli.
Le projet combinera microbiologie expérimentale, génétique bactérienne, approches CRISPRi et analyses bioinformatiques afin d’identifier les déterminants moléculaires et génétiques impliqués dans les variations de réponse au stress entre souches. La personne recrutée assurera notamment le lien entre caractérisation phénotypique, perturbation génétique et analyse comparative des génomes.

Activités :
• Culture et manipulation de souches cliniques d’Escherichia coli.
• Construction de souches bactériennes mutantes et de plasmides.
• Construction, manipulation et/ou exploitation de banques de souches, notamment par approches CRISPRi.
• Mise en place de tests phénotypiques permettant d’évaluer la croissance, la survie et la tolérance des souches à différents stress, en particulier aux stress antimicrobiens.
• Réalisation de techniques de microbiologie, génétique bactérienne et biologie moléculaire.
• Analyse de génomes bactériens et comparaison de génomes issus de différentes souches.
• Analyse bioinformatique de données génomiques et identification de variations génétiques associées aux phénotypes observés.
• Intégration, analyse statistique et visualisation de données génomiques et phénotypiques.
• Interprétation des résultats expérimentaux et bioinformatiques dans le contexte de l’adaptation bactérienne au stress.
• Participation à la rédaction de publications scientifiques et à la présentation des résultats.

Contexte de travail :
La personne recrutée rejoindra l’équipe « Réponses épitranscriptionnelles au stress antimicrobien », dirigée par Zeynep Baharoglu, au sein du Laboratoire d’Expression Génétique Microbienne de l’Institut de Biologie Physico-Chimique (IBPC), à Paris.
Les recherches de l’équipe portent sur les mécanismes moléculaires permettant aux bactéries de s’adapter aux stress environnementaux et antimicrobiens, avec un intérêt particulier pour les modifications post-transcriptionnelles des ARN et leur rôle dans la régulation de la traduction.
Le projet portera plus spécifiquement sur l’étude de souches cliniques d’Escherichia coli et combinera approches de microbiologie, génétique bactérienne, CRISPRi, génomique comparative et bioinformatique.
La personne recrutée travaillera en interaction étroite avec les membres de l’équipe et les collaborateurs impliqués dans les analyses génomiques et bioinformatiques.