Contrat Doctoral (H/F) en Intelligence Artificielle Générative pour la Modélisation de la Flexibilité d
Référence : UPR8001-JUACOR-012
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 31031 TOULOUSE (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD de 3 ans
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Sujet de thèse :
Les protéines intrinsèquement désordonnées constituent une classe importante de biomolécules impliquées dans de nombreux processus biologiques. Contrairement aux protéines classiques, elles ne possèdent pas une structure unique mais adoptent un grand nombre de conformations différentes. Cette flexibilité est essentielle à leur fonction mais rend leur étude particulièrement difficile.
L'objectif de cette thèse est de développer de nouvelles méthodes d'intelligence artificielle capables de prédire directement les ensembles de conformations adoptées par ces protéines à partir de leur séquence. Le projet s'appuiera sur les avancées récentes en apprentissage profond, notamment les modèles génératifs de type flow matching et les modèles de langage pour protéines.
Les travaux viseront à concevoir des modèles permettant une génération rapide et réaliste de conformations protéiques, tout en intégrant des connaissances issues de la physique statistique et de la biologie structurale. Les méthodes développées seront évaluées à l'aide de données de simulation et de mesures expérimentales obtenues en collaboration avec des biologistes.
Cette thèse se situe à l'interface entre intelligence artificielle, apprentissage automatique, physique computationnelle et biologie moléculaire, et contribuera au développement de nouvelles approches pour l'étude et la conception de protéines flexibles.
Compétences attendues:
• Master 2 ou diplôme d’ingénieur avec spécialisation en informatique, intelligence artificielle, mathématiques appliquées, physique computationnelle ou domaine connexe ;
• Solides connaissances en apprentissage automatique, probabilités et statistiques ;
• Maîtrise de la programmation scientifique en Python et des bibliothèques d’apprentissage profond (PyTorch ou équivalent) ;
• Intérêt pour les modèles génératifs et les méthodes d’IA modernes ;
• Goût pour la recherche interdisciplinaire à l’interface entre intelligence artificielle, physique statistique et biologie ;
• Bon niveau d’anglais scientifique ;
• Autonomie, curiosité, rigueur et aptitude au travail collaboratif.
Contexte :
La thèse sera réalisée au sein de l’équipe RIS du LAAS-CNRS à Toulouse, sous la direction de chercheurs spécialisés en intelligence artificielle, modélisation mathématique et biologie computationnelle. Le projet s’inscrit dans un environnement interdisciplinaire associant apprentissage automatique, physique statistique et biologie structurale.
Le doctorant ou la doctorante collaborera également avec des partenaires académiques spécialisés en modélisation probabiliste et en biophysique expérimentale, notamment dans le cadre d’échanges avec des équipes de recherche à Paris et Montpellier. Les travaux bénéficieront d’un accès aux ressources de calcul scientifique du laboratoire et du CNRS.
Profil recherché
Contraintes et risques :
Travail principalement réalisé sur ordinateur dans un environnement de bureau et de recherche. Aucun risque particulier identifié.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Formations générales
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Chercheuse / Chercheur
