Doctorant Biologie moléculaire et cellulaire (H/F)

Sujet de thèse :
La principale cause génétique des tumeurs atypiques tératoïdes/rhabdoïdes est la mutation du gène Smarcb1. Pourtant, l'inactivation de ce gène dans de nombreuses lignées cellulaires entrave la prolifération cellulaire et fait l'objet d'une forte contre-sélection. De plus, nous avons montré qu'un contexte développemental spécifique est nécessaire pour que SMARCB1 favorise la prolifération cellulaire. Cela soulève la question de savoir quels facteurs contrôlent l'issue cellulaire de l'inactivation de SMARCB1.Pour répondre à cette question, nous proposons de créer divers modèles d'inactivation aiguë de Smarcb1 (CRISPRi et degron) et de réaliser des criblages génétiques afin d'identifier les gènes dont l'expression altérée permet aux cellules de survivre à la délétion de SMARCB1. Nous étudierons ensuite comment ces gènes sont régulés au cours du développement, en particulier au stade où l'on pense que l'ATRT apparaît. Nous manipulerons leur expression dans des lignées cellulaires ATRT et des modèles PDX afin de déterminer leur contribution à la tumorigenèse. Enfin, nous utiliserons notre modèle de dégradation aiguë de SMARCB1 pour identifier ses gènes cibles directs et précoces (CUT&RUN, TT-seq, HiChIP, protéome) et approfondir l'étude de son mécanisme d'action.
Contexte :
Le/la doctorant(e) sera accueilli.e au sein de l'UMR3215 sur le campus de l'institut Curie (Paris 05) et travaillera sous la direction de R. Margueron. L'étudiant sera affilié à l'école doctorale complexité du vivant (CDV515). Ce recrutement s’inscrit dans le cadre du PEPR Cell-ID.