Doctorant en « Evo-Immuno : Innovations de l’immunité innée antivirale des chauves-souris Myotis » H/F
Référence : UMR5308-CARLAZ-013
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 69364 LYON 07 (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD de 3 ans
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels La rémunération est de 2 300€ brut mensuel € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Sujet de thèse :
Thèse de Doctorat sur l’évolution fonctionnelle de l’immunité innée antivirale des chauves-souris du genre Myotis (directrice de thèse : Lucie ETIENNE, CIRI, ENS-Lyon)
Ce projet de recherche de doctorat vise à identifier et caractériser les innovations génomiques, en particulier duplications de gènes et réarrangements de domaines protéiques, responsables des spécificités antivirales des chauves-souris du genre Myotis. Le doctorant ou la doctorante caractérisera l'histoire évolutive et fonctionnelle des gènes de l'immunité innée de Myotis, en collaboration avec des membres de l’équipe experts en bio-informatique/génomique/phylogénétique, et identifiera ceux qui sont responsables de réponses antivirales spécifiques. Pour cela, il/elle utilisera les modèles cellulaires multi-individus/espèces et virologiques récemment développés au laboratoire, dans des criblages perte de fonction et gain de fonction antivirale, grâce à une plateforme d'imagerie confocale à haut débit avec marquage fluorescent cellulaire et viral. La caractérisation évolutive et mécanistique d’une à trois innovations immunitaires sera réalisée.
Le doctorant ou la doctorante aura ainsi des activités interdisciplinaires, principalement de virologie moléculaire, immunité innée et biologie cellulaire d’espèces non-modèles, mais également de phylogénomique et protéomique.
- Il ou elle réalisera et développera des protocoles expérimentaux de réplications virales en laboratoires de sécurité de niveau 2 et 3, manipulation génétique de cellules de mammifères, biologie cellulaire (lignées cellulaires humaines et autres mammifères, FACS, microscopie confocale à fluorescence à haut débit), biochimie et biologie moléculaire (clonage, western blot, qPCR, extractions ARN/ADN).
- Il ou elle réalisera et développera des analyses bio-informatiques de deux ordres : d’une part l’analyse des données d’imagerie haut débit, et d’autre part les analyses phylogénomiques/protéomiques des gènes d’intérêt.
- Ensemble des activités spécifiques à une formation doctorale.
Compétences attendus :
Compétences en biologie cellulaire, biologie moléculaire, virologie, immunologie.
Compétences en bio-informatique.
Une expérience préalable ou une formation en analyse de données d’imagerie est un plus.
Une expérience préalable ou une formation en biologie évolutive est un plus, mais pas un prérequis.
Une excellente communication en anglais est attendue.
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Contexte :
La thèse sera réalisée au CIRI. Le CIRI rassemble des communautés de recherche scientifique et médicale en infectiologie de Lyon-St Etienne avec pour tutelles principales l’Université Lyon 1, l’Inserm, le CNRS et l’ENS de Lyon, tutelles secondaires les Hospices Civils de Lyon et l’Université Jean Monnet, en partenariat avec VetAgroSup et l’Institut Pasteur. Ce sont plus de 400 chercheurs et chercheuses d’horizons disciplinaires complémentaires regroupés en 3 spécialités principale
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...
Profil recherché
Contraintes et risques :
Déplacements internationaux pour des conférences ou des collaborations.
Travail en environnement BSL-3.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Formations générales
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Chercheuse / Chercheur
