Doctorant en Biologie des systèmes computationnelle / Bio-informatique (H/F)

Référence : UMR5077-MARPEL1-021

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 31062 TOULOUSE (France)
Domaine : Recherche
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Date limite de candidature : 20/05/2026

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat

    CDD de 3 ans
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Sujet de thèse :
Le projet DigiTREAT est financé dans le cadre du programme PEPR Santé numérique (France 2030 – ANR) afin de développer le premier jumeau numérique médical multi-échelle dédié à la polyarthrite rhumatoïde (RA-DT). Le projet est coordonné par le professeur Anna Niarakis au Centre de Biologie.
Le/La doctorant(e) travaillera sur la construction et le calibrage d'un modèle générique multi-échelle intégrant des données omiques accessibles au public. Pour cela, il/elle devra :
- Analyser et intégrer des ensembles de données omiques issues de cellules individuelles et de populations.
- Développer des modèles computationnels prédictifs.
- Étalonner et valider des modèles computationnels à l'aide de données expérimentales.
- Améliorer des performances prédictives et de la précision biologique.
- Contribuer à la découverte de biomarqueurs.
La personne recrutée devra être titulaire d'un Master Bio-Informatique, Biologie Computationnelle ou dans un domaine connexe. Le projet requiert une expérience avec les données omiques (scRNA-seq et/ou bulk), des compétences en programmation : R, Python (la maîtrise de C++ est un atout), de solides compétences analytiques et interdisciplinaires, ainsi que la maîtrise de l'anglais.
Contexte :
Le projet DigiTREAT, financé par le programme PEPR Digital Health, vise à développer un jumeau numérique multi-échelle pour la polyarthrite rhumatoïde (PR) en intégrant la modélisation computationnelle, les données omiques et les cohortes cliniques. Le projet répond à un besoin clinique majeur non satisfait : prédire la réponse au traitement dans les maladies auto-immunes complexes.
Le poste est basé au Centre de Biologie Intégrative (CBI) de Toulouse, un centre de recherche commun au CNRS et à l'Université Toulouse III – Paul Sabatier dédié à la biologie intégrative à toutes les échelles. Le candidat rejoindra la division de biologie des systèmes et sera supervisé par le professeur Anna Niarakis.
https://cbi-toulouse.fr/en/equipe/pole-de-biologie-des-systemes-en/
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Profil recherché

Contraintes et risques :

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant

  • Chercheuse / Chercheur

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