Doctorant en glycobiologie (H/F)

Sujet de thèse :
Projet de la thèse : Dynamique de l’acylation des lignines chez le peuplier et Miscanthus

Description du projet de thèse :
Les lignines sont parmi les principaux composants de la biomasse et sont obtenues comme produits secondaires des industries de pâte à papier et des bioraffineries de deuxième génération. De nouveaux procédés d’extraction émergent aujourd’hui, et ces composés, initialement considérés comme des déchets et principalement utilisés pour la production de chaleur, suscite de plus en plus d’intérêt en raison de leur composition chimique et de leur abondance.
En effet, la valorisation des lignines contribuerait clairement à la construction d’une économie plus durable fondée sur le carbone issu des ressources végétales, en alternative aux applications reposant sur le pétrole fossile, suscitant ainsi un intérêt croissant de la part du monde académique, industriel et des acteurs publics.
Dans ce contexte, le projet LILLEGNIN vise à mettre en place sur le site de Lille une chaîne de valeur complète dédiée à la valorisation de la lignine. Le projet intègre des expertises complémentaires telles que la biologie des matières premières végétales, l’extraction innovante des lignines et leur transformation (bio)catalytique, ainsi que diverses voies innovantes de valorisation dans les domaines du textile, des matériaux ignifuges, des biocarburants et de l’électronique.
L’Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF, Université de Lille) est impliquée dans le projet du fait de son expertise dans l’étude de la dynamique de la biosynthèse et de l’incorporation de molécules au sein de différents types de biopolymères. La paroi secondaire végétale est un composite incluant une matrice polysaccharidique renfermant notamment des lignines. Nos approches biologiques et biochimiques permettent de mieux comprendre les interactions et interdépendances entre ses composants et ainsi, de mieux appréhender leur extractibilité. Parmi les différents paramètres qui vont justement agir sur ces interactions, la présence de groupements acyles sur les lignines va avoir une influence significative, et ainsi faciliter leur extraction.
L’acylation des lignines est retrouvée chez tous les angiospermes, mais est absente chez les gymnospermes. Leur rôle précis n’est toutefois pas encore bien connu. Ces groupements acyles permettent parfois de former des complexes entre les lignines et les polysaccharides pariétaux, stabilisant ainsi la structure tridimensionnelle de la paroi. En conséquence, l’accès aux hydrolases sera impacté rendant ainsi variable la dégradation des polysaccharides.

Le travail se déroulera au sein de l’UGSF situé sur le campus Cité Scientifique à Villeneuve d’Ascq (59). Le projet de thèse sera structuré autour de différents objectifs.
Il s’agira dans un premier temps de caractériser le matériel végétal constitué de plants de peuplier qui seront cultivés sur place (platefor
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