Doctorant (H/F) en biologie des membranes

Sujet de thèse :
Les lipides membranaires ne sont pas seulement essentiels à la formation des bicouches lipidiques. Ils interviennent dans la signalisation, l'identité des organites et la régulation des propriétés physiques des membranes. Cependant, la manière dont différents lipides régulent les fonctions cellulaires dans des conditions physiopathologiques reste mal comprise. En particulier, on ignore comment les fonctions des différentes protéines membranaires (canaux ioniques, récepteurs, etc.) sont régulées par leur environnement membranaire. Par conséquent, un pan entier de la régulation des processus biologiques demeure inexploré. En déterminant comment les structures détaillées des lipides (par exemple, les lipides polyinsaturés oméga-3 et oméga-6) affectent les fonctions biologiques, nous pourrions comprendre comment la composition membranaire influence diverses maladies, ou comment différents régimes alimentaires impactent notre santé.

Dans ce projet, nous nous concentrerons sur la phosphatidylsérine, un lipide membranaire important impliqué dans l'apoptose, le trafic membranaire et la signalisation. Nous utiliserons une approche combinant ingénierie génétique cellulaire et lipidomique, une méthode analytique permettant la détection exhaustive des lipides, afin d'élucider la régulation métabolique de la structure de la phosphatidylsérine (ses deux chaînes hydrophobes). Nous ciblerons plusieurs enzymes récemment découvertes, ce qui nous permettra d'explorer de nouvelles voies métaboliques.

De plus, nous étudierons les rôles physiologiques de la phosphatidylsérine en analysant l'impact de modifications structurales sur diverses protéines membranaires. Pour ce faire, nous exprimerons les protéines d'intérêt dans des cellules modifiées présentant une structure de phosphatidylsérine altérée, puis nous mesurerons leur activité et leur localisation. Ceci nous permettra d'établir un lien, avec une précision sans précédent, entre la structure d'un lipide et ses fonctions.

Ce projet sera mené en collaboration avec une autre équipe de l'Université de Tokyo, au Japon, et des visites au laboratoire de nos collaborateurs sont prévues. Cette collaboration permettra à l'étudiant de transposer les résultats obtenus en expériences in vivo, établissant ainsi des liens étroits entre la structure de la phosphatidylsérine et la physiologie.

Grâce à ce projet, l'étudiant acquerra des connaissances approfondies en génie génétique, lipidomique/métabolomique, métabolisme des lipides, imagerie, biochimie et biologie moléculaire et cellulaire.
Contexte :
L’Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (IPMC) est un centre de recherche du CNRS, de l’Inserm et de l’Université Côte d’Azur (UCA), situé à Sophia Antipolis, près de Nice et d’Antibes. Ce centre pluridisciplinaire regroupe 22 équipes de recherche couvrant des domaines variés tels que la biologie membranaire, la neurobiologie, l’endocrinologie e
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