Doctorant/e Programme Cell-ID (H/F)

Sujet de thèse :
Étude des dépendances métabolomiques dans le médulloblastome M/F
La perturbation des réseaux biologiques constitue un événement clé dans le cancer, dont la compréhension devrait ouvrir la voie à de nouvelles stratégies thérapeutiques. Dans le médulloblastome (MB), la tumeur cérébrale maligne pédiatrique la plus fréquente issue du cervelet, les dérégulations des réseaux restent encore mal comprises, ce qui limite les avancées thérapeutiques. Le MB est une maladie hétérogène ; les sous-groupes génétiques actuellement définis comprennent les tumeurs activées pour la voie Wingless (WNT), celles dépendantes de Sonic Hedgehog (SHH), ainsi que les sous-groupes non-WNT/non-SHH. Ces dernières correspondent aux sous-groupes moléculaires « groupe 3 » et « groupe 4 », qui représente la majorité des cas de MB. Bien que plusieurs études aient dressé un panorama génomique, épigénétique et transcriptomique des échantillons humains de MB, elles n'ont pas encore permis d'atteindre une compréhension globale des réseaux biologiques complexes associés à cette maladie.

Dans le prolongement de nos travaux antérieurs (Forget et al., Cancer Cell, 2018 ; Hovestadt et al., Nature Reviews Cancer, 2020), nous avons récemment réalisé une analyse intégrative protéomique et métabolomique de grande envergure. Celle-ci inclut : le génome (WGS), l'épigénome (850K), le transcriptome (RNA-seq), le protéome (spectrométrie de masse (MS)), le phosphoprotéome (MS) et le métabolome ainsi que les données cliniques associées sur une cohorte de 384 échantillons de patients atteints de MB.
Grâce à nos analyses protéogénomiques et métabolomiques réalisées sur l’ensemble des cas de MB, nous avons mis en évidence une signature métabolique spécifique dans le sous-groupe le plus agressif de MB, tant au niveau du protéome que du métabolome.

Compte tenu de ces résultats, le projet proposé vise à approfondir l'étude de cette dépendance métabolique. Plus précisément, nous allons :
Objectif 1 : Caractériser cette signature à la fois dans le contexte du développement normal et dans celui du MB
Objectif 2 : Décrypter les mécanismes cellulaires et moléculaires associés à cette signature dans le MB
Ces travaux impliqueront l'utilisation de plusieurs approches de pointe telles que le séquençage unicellulaire, la protéomique ou la microscopie avancée.
Dans l'ensemble, ce projet devrait permettre de mieux cerner les vulnérabilités métaboliques dans la MB et, par conséquent, ouvrir la voie au développement de nouvelles stratégies thérapeutiques prometteuses pour les patients appartenant au sous-groupe au pronostic le plus défavorable.


Contexte :
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué́ d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité́ internationale. L’objectif du Centre de recherche de l’institut Curie est de dévelop
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