Doctorat en évo-devo chez les vertébrés: mécanismes de formation des asymétries épithalamiques chez les

Sujet de thèse :
Une caractéristique remarquable de l'épithalamus est qu'il présente, chez un grand nombre de vertébrés, des asymétries plus ou moins marquées entre la gauche et la droite. Des analyses comparées entre des espèces appartenant aux ostéichtyens, aux chondrichtyens et aux cyclostomes indiquent que malgré une variabilité considérable dans leur degré et leur nature, ces asymétries ont une origine ancienne dans le taxon. Les variations des mécanismes du développement embryonnaire qui rendent compte à la fois de cette unité et de ces diversifications restent mal connues. Des données obtenues chez le poisson-zèbre et un poisson cartilagineux, la petite roussette, suggèrent que chez les vertébrés ancestraux, la voie Wnt était employée à plusieurs reprises dans la formation des asymétries épithalamiques, et cela dans plusieurs territoires épithalamiques, avec des fonctions cellulaires et des modalités de régulation également distinctes. Dans ce scénario, une rétention différentielle de ces rôles selon les taxons pourrait rendre compte des variations des asymétries épithalamiques observées chez les vertébrés. Le projet de thèse proposé vise à tester cette hypothèse par l'étude d'un cyclostome, la lamproie de rivière. Plus spécifiquement, il s'agira:
- de décrypter les mécanismes moléculaires et cellulaires dont dépend la formation des asymétries épithalamiques chez la lamproie de rivière, en s'intéressant notamment aux rôles de la voie Wnt
- de comparer ces mécanismes à ceux mis en oeuvre dans la formation de l'épithalamus et de ses asymétries chez la roussette ou le poisson-zèbre, afin d'inférer l'état ancestral des vertébrés.

La stratégie expérimentale reposera sur trois approches:
1. une reconstruction des asymétries des trajectoires cellulaires au cours du développement de la lamproie de rivière en vue de comparaisons à celles obtenues chez la petite roussette: technique snRNA-seq (SPLIT-seq)
2. la caractérisation de la distribution spatiale des différents états de progéniteurs neuraux ou précurseurs neuronaux des principaux territoires épithalamiques et une analyse des profils d'expression de composants et régulateurs de la voie Wnt, à des stades clés du développement prolarvaire et larvaire: technique Stereo-seq, ISH (hybridation in situ), HCR (hybridization chain reaction)-ISH
3. la détermination des rôles cellulaires et moléculaire de la voie Wnt, par des analyses fonctionnelles de ses composants et régulateurs: techniques, traitements pharmacologiques, édition de gènes par la technique CRISPR-cas9.

Références:
Guichard et al. 2025. The lamprey habenula provides an extreme example for the temporal regulation of asymmetric development. Front. Cell Dev. Biol. 13:1528797.
Lanoizelet et al. 2024. Analysis of a shark reveals ancient, Wnt-dependent, habenular asymmetries in vertebrates. Nature Commun., 15:10194.
Michel et al. 2022. Diversification of habenular organization and asymmetr
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