Doctorat (H/F) - Mécanique du glycocalyx et contrôle de l’adhésion bactérienne

Sujet de thèse :
Les candidatures sont ouvertes pour un poste de doctorant(e) d’une durée de 36 mois au sein du réseau doctoral Marie Skłodowska-Curie GLYCOCALYX.

A PROPOS DU RESEAU
GLYCOCALYX (glycocalyx.org) rassemble 15 partenaires européens de premier plan au sein d’un réseau transnational. Il met en œuvre un programme de recherche et de formation multidisciplinaire entre partenaires académiques et industriels, afin d’étudier l’auto-organisation et les fonctions barrières du glycocalyx des mammifères.
Pratiquement toutes les cellules de mammifères sont recouvertes d’une couche dense et complexe de polymères de sucres appelée glycocalyx, essentielle à la vie multicellulaire. Les glycocalyx jouent un rôle clé dans la communication intercellulaire, le développement des tissus, l’homéostasie, la réparation, les réponses inflammatoires et immunitaires, la connectivité neuronale, ainsi que dans la symbiose avec les bactéries. Cependant, lorsqu’ils sont dérégulés, ils peuvent favoriser des maladies immunitaires, des neuropathies et des cancers. Les glycocalyx agissent également comme première ligne de défense contre les pathogènes, mais certains pathogènes ont évolué pour détourner le glycocalyx afin de promouvoir l’infection.
Malgré leur importance, les glycocalyx des mammifères restent la « matière noire » de la biologie, peu étudiés en raison du manque historique d’outils préparatifs et analytiques pour sonder la composition moléculaire locale et les interactions transitoires des molécules au sein des glycocalyx, ainsi que de règles physiques pour interpréter les observations expérimentales.
Le réseau GLYCOCALYX formera 15 doctorantes et doctorants aux méthodes et concepts de physique, chimie et biologie nécessaires pour élucider l’organisation dynamique des glycocalyx. Le projet éclairera les mécanismes par lesquels les glycocalyx remplissent leurs nombreuses fonctions de barrière sélective. Les doctorant(e)s recevront une formation scientifique de pointe, ainsi que des compétences transférables pertinentes pour l’industrie.

À PROPOS DU PROJET DE THESE – Mécanique du glycocalyx et contrôle de l’adhésion bactérienne
En tant que doctorant ou doctorante MSCA à Grenoble, vous étudierez comment les bactéries adhèrent à des modèles de glycocalyx aux propriétés physico-chimiques variées, et développerez des modèles analytiques pour rationaliser vos résultats expérimentaux.
Les bactéries pathogènes comme P. aeruginosa sont sensibles à leur environnement biochimique et mécanique. Nous avons récemment démontré, avec d’autres équipes, que la colonisation de surface par ces bactéries est fortement influencée par l’élasticité de la surface (de l’ordre du kPa). À l’inverse, les glycocalyx des mammifères agissent comme des barrières contrôlant la colonisation des pathogènes sur les endothélia et épithélia, et leur extrême déformabilité (rigidité de l’ordre de 1 à 100 Pa) pourrait jouer un rôle clé dans la ré
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