H/F - L'histoire cachée des triglycérides dans les poteries archéologiques

Sujet de thèse :
A - État de l’art
Si l’alimentation répond à un besoin physiologique primaire de tout organisme vivant, elle est aussi, dans les sociétés humaines, un vecteur de structuration sociale, le siège de pratiques culturelles et un réservoir de savoirs, de savoir-faire et de techniques. Explorer les stratégies alimentaires des populations du passé est une tâche ardue car ces stratégies reposent sur l’ingestion de substances dont les vestiges ne se conservent que partiellement dans le registre archéologique. Fondé sur une collaboration originale et inédite entre ethno-archéologie, archéologie et biochimie, ce projet de thèse se propose d’explorer le potentiel informatif de triglycérides (TAGs) conservés dans des céramiques ethnographiques africaines et dans des poteries archéologiques de différents contextes européens et africains afin de lever des verrous d’identification des denrées alimentaires conservées au sein de récipients en céramique, qu’il s’agisse de matières grasses animales ou de substances végétales.
Au cours des dernières décennies, l’analyse des résidus organiques de poteries archéologiques (ORA – Organic Residue Analysis) a connu d’importants développements méthodologiques. Ces avancées ont permis d’identifier une grande diversité de denrées alimentaires dans différentes aires chrono-culturelles. Toutefois, malgré ces progrès, notre compréhension des stratégies alimentaires anciennes demeure partielle. Nous manquons encore de référentiels robustes et transculturels permettant d’attribuer de manière fiable une fonction aux poteries archéologiques. En outre, le potentiel chimiotaxonomique de certains biomarqueurs, tels que les triglycérides, reste largement inexploité, nous privant de méthodes d’identifications fines pour discriminer l’espèce à l’origine d’une graisse animale ou de produits laitiers ou distinguer certaines huiles végétales entre elles. La recherche des produits issus de la mer demande aussi de lever un certain nombre de verrous méthodologiques.

B - Objectifs
L’objectif de ce projet est d’explorer le potentiel chimiotaxonomique des TAGs en contexte archéologique afin d’accéder à une identification précise des matières grasses préparées et consommées dans les céramiques et de contribuer à une meilleure connaissance des stratégies alimentaires des populations du passé. Pour atteindre cet objectif, le projet vise à lever plusieurs verrous scientifiques et méthodologiques majeurs : i) développer un référentiel de substances grasses actuelles afin d’établir des critères de discrimination basés sur leur composition en TAGs ; (ii), développer et valider une méthode d’analyse LC-MS/MS innovante et robuste dédiée aux TAGs et mettre en œuvre des méthodes statistiques multivariées et des méthodes d’apprentissage automatique adaptées (machine learning) pour le traitement de jeux de données de grande dimension ; (iii) évaluer l’évolution du signal en TAGs sous l’effet
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