H/F Doctorant / Doctorante en Sciences de la Vie

Référence : UMR7281-AURBIM-061

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 13402 MARSEILLE 09 (France)
Domaine : Recherche
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Date limite de candidature : 12/08/2026

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat

    CDD de 3 ans
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Sujet de thèse :
Adaptation des bactéries à leur environnement : dynamique structurale d’un système protéique couplant le chaperon DnaK à la transcription
Le projet est basé sur la découverte récente d'un opéron, nommé atc pour adaptation to cold, essentiel à la croissance à basse température chez la bactérie aquatique mésophile Shewanella oneidensis. Cet opéron code 4 protéines : une protéine à domaine J (AtcJ), co-chaperon du chaperon moléculaire DnaK, et 3 protéines de fonctions inconnues (AtcA, AtcB et AtcC). AtcB interagit avec l'ARN polymérase bactérienne. Certaines interactions entre des protéines du système Atc sont en outre essentielles à la croissance au froid de S. oneidensis. On suppose que les protéines Atc jouent un rôle dans le recrutement de DnaK pour moduler l'activité de l'ARN polymérase et permettre une transcription efficace de gènes clés dans des conditions de froid. Ce système constituerait un mécanisme original de régulation de l’expression génétique couplant le chaperon DnaK à l’ARN polymérase mais dont les modalités restent à élucider.
L’objectif de ce projet collaboratif à l’interface Biologie/Chimie/Physique est d’étudier l’organisation et la dynamique structurale associée au fonctionnement de ce réseau de protéines. Pour cela, une approche pluridisciplinaire et intégrative sera mise en place combinant des approches de biochimie des protéines, et de spectroscopies de résonance magnétique (RM) associant la RPE (résonance paramagnétique électronique) et la RMN (résonance magnétique nucléaire) basées sur sur l'introduction de sondes paramagnétiques (nitroxydes).

Contexte :
Co-Directeur de thèse : COUSIN Samuel
Institut de Chimie Radicalaire (ICR, UMR 7273): équipe “Spectrométries Appliquées à la Caractérisation Structurale” (SACS)

Co-encadrante : MARTINHO Marlène
Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM, UMR 7255), équipe « Dynamique et Assemblage des protéines membranaires »

Le consortium de recherche regroupe des chercheurs dépendant de deux instituts différents du CNRS (CNRS Biologie et CNRS Chimie), ayant des expertises complémentaires et nécessaires à la description fine du réseau d’interaction du système Atc. Le laboratoire BIP sera responsable de la production du système biologique (production et purification des protéines Atc seules ou en complexe avec divers partenaires comme AtcJ, DnaK …). Le laboratoire LISM sera responsable des études de dynamique locale des protéines et de leurs interactions par une approche basée sur des réactions de marquage à l’aide de sondes paramagnétiques, et leur étude par la RPE . L’ICR assurera l’acquisition et l’analyse des spectres RMN du ¹⁵N, en vue de l’attribution des résonances, de l’étude des effets PRE et de la dynamique du squelette peptidique.
Le ou la doctorant(e) dépendra de l’ED658 d’Aix-Marseille Université qui propose des formations dans le domaine des sciences du vivant.

Profil recherché

Contraintes et risques :
Contraintes usuelles liées au travail en laboratoire de biologie. Déplacements éventuels pour collaboration et participation à des conférences. Le ou la doctorante sera localisé(e) au BIP, sur le Campus CNRS Joseph Aiguier, 13009 Marseille, où les expériences de Biologie, RPE et RMN seront réalisées. Certaines expériences de RMN pourront être réalisées au campus de Saint-Jérôme (13013 Marseille).

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant

  • Chercheuse / Chercheur

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