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H/F Ingénieur de recherches généraliste pour le dévelopment d'outils expérimentaux et analytiques en ne

Référence : UMR9197-JULBOU-023

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 91400 SACLAY (France)
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) entre 2848 € et 3620 € bruts mensuels, selon expérience professionnelle et grille des salaires du C € brut/an
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Implémenter et développer des outils matériels, informatiques et analytiques pour l'acquisition et l'exploitation de données dans le cadre d'un projet de recherches en Neurosciences sur le contrôle nerveux des mouvements, chez la souris.
Activités :
- Concevoir des outils d’exploitation, en aval du travail expérimental, des données cinématiques des mouvements de l'animal par suivi vidéo par Deep Learning, ou par Motion Capture, pour en extraire des métriques pertinentes et procéder à des classifications supervisées et non-supervisées des différents types de comportements exprimés par l'animal.

- Implémenter des outils d'acquisition de signaux, et de commande en boucle fermée pour le pilotage de certains instruments de mesure, à l’aide d’un logiciel de programmation réactive visuelle (Bonsai).

- Continuer le développement déjà initié dans le laboratoire, en concertation avec les expérimentateurs, d'un pipeline d’analyse d’images histologiques, permettant d'identifier les objets d'intérêt (cellules ou process neuronaux) et de les cartographier dans un cerveau de référence, basé sur des logiciels libres et des scripts développés au laboratoire.

- Concevoir des guides et tutoriels pour la formation des utilisateurs à ces méthodes.

- Assurer un support à l’équipe en bio-ingénierie et informatique scientifique.

Contexte de travail :
Le.la candidat.e rejoindra l'équipe dirigée par Julien Bouvier, circuits neuronaux et contrôle moteur, (https://neuropsi.cnrs.fr/departements/icn/equipe-julien-bouvier/), composée d’un directeur de recherche, d’une ingénieure d’études, d’un assistant ingénieur, de 2 ingénieurs de recherches, de deux étudiants en thèse et de plusieurs étudiants en licence et master. Au sein de l’institut, il.elle pourra interagir avec une équipe spécialisée dans l’analyse de données.
L'Institut des Neurosciences Paris-saclay (Neuro-PSI) est implanté sur le site du CEA à Saclay et regroupe 21 équipes de recherche, des plateformes et services techniques permettant l'étude du fonctionnement cérébral chez plusieurs modèles animaux à tous les niveaux.

L'accès au site CEA est desservi par un service de bus à partir du RER le guichet et Massy.

Profil recherché

Competences :
Nous recherchons une personne avec un intérêt pour le développement et l’optimisation d'outils expérimentaux et analytiques en neuroscience et maîtrisant la programmation (par ex Python, R, Matlab, C#). La personne doit être astucieuse, persévérante, connaître les plateformes de dissémination des codes informatiques (par ex Github) et capable de prendre des initiatives pour faire avancer les projets. Une formation d’école d’ingénieur ou de doctorat est attendue, incluant notamment une ou plusieurs des spécialités suivantes : traitement d’image, traitement du signal, mathématiques et informatique appliquées, bioingénierie, optique, microscopie, machine vision, ou une expérience avérée dans ces domaines.
Une aisance avec les outils informatiques en général (Windows ou Linux,…) et un sens de la pédagogie sont attendus.
Des connaissances en électronique, mécanique, impression 3D seront un atout.
Une maîtrise suffisante de l’anglais scientifique est attendue.

Contraintes et risques :
Beaucoup de travail à l’ordinateur.
Certaines tâches se feront dans une zone hébergeant des souris (allergènes).

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  • Spécialisation Spécialités pluriscientifiques

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • - Congés annuels / RTT : 44 jours
    - Restaurant d'entreprise
    - Transport : RER B à proximité - prise en charge (75% du coût) et forfait mobilité durable jusqu’à 300 €
    - Offres sociales : participation à la mutuelle, restauration collective, sport et loisirs, billetterie…

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant
  • Experte / Expert en instrumentation et expérimentation

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