H/F, Offre de post-doc sur : Spécialiste du microbiome et approches metabarcoding

Référence : UMR5300-PHIHEE-001

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 31062 TOULOUSE (France)
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Date limite de candidature : 02/05/2026

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat

    CDD d'1 an

  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels entre 3041€ et 4395€ brut mensuel selon expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Le CRBE Centre de Recherche sur la Biodiversité et l’environnement, est une unité mixte de recherche (UMR5300) dont les thématiques scientifiques s’articulent autour de l’influence des changements environnementaux et de leurs interactions avec la terre vivante, et les rétroactions des systèmes socio-écologiques sur ces changements. La personne travaillera en collaboration avec Philipp Heeb & Joël White en collaboration avec une thésarde et aura pour mission d’analyser des données de séquençage issues de projets pluriannuels et à large échelle afin d’examiner les facteurs écologiques et phénotypiques qui façonnent le microbiote intestinal des oiseaux. Elle effectuera en outre un travail d’analyses moléculaires et de traitement bioinformatique sur des données de metabarcoding alimentaire (projet ANR Copa-Co)
Activités :
- Analyses statistiques et approches multivariées sur données de metabarcoding 16S
- Rédaction d’articles scientifiques et communications
- Analyses en biologie moléculaire (Extraction, PCR, préparation de librairies et séquençage) sur ADN fécal et optimisation des protocoles
- Traitement bioinformatique des données de metabarcoding alimentaire
Contexte de travail :
Nos recherches visent à mieux comprendre le rôle du microbiote intestinal dans la réponse des organismes face aux perturbations anthropiques de leur environnement. Nous explorons en particulier l’impact de l’urbanisation sur les interactions hôte-microbiote chez les mésanges. Télétravail possible sur une journée flottante par semaine sous condition de l’autonomie de l’agent et de la déclaration via les outils de la tutelle

Profil recherché

Competences :
- Compétences en sequençage en approche par metabarcoding
- Compétences en bioinformatique
- Compétences en analyses statistiques multivariées
- Compétences rédactionnelles et valorisation des données
- Maitrise des techniques de biologie moléculaire
- Proactivité, autonomie et rigueur
- Capacité à travailler en équipe
Contraintes et risques :
Le travail consistera principalement à réaliser des analyses en bioinformatique au sein des ressources informatiques et plateforme B2M du CRBE. La possibilité de participer au travail de terrain sera examinée au cours du contrat.

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant
  • Chercheuse / Chercheur

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