Ingénieur / Ingénieure en Microbiologie H/F

Missions :
Nos travaux de recherche portent sur Myxococcus xanthus, une bactérie prédatrice capable de tuer et de lyser ses proies par contact direct. Lors de l’interaction avec une bactérie proie, deux nanomachines essentielles à la prédation sont recrutées et assemblées au niveau du site de contact : le système Kil, homologue à un pilus Tad, et un système de sécrétion de type III atypique, appelé T3SS*, dépourvu d’aiguille (Seef S et al. 2021 eLife, Herrou J et al. 2025 Nat. Commun.).

L’absence de l’un ou l’autre de ces systèmes entraîne une perte de l’activité prédatrice, indiquant qu’ils jouent un rôle essentiel dans le processus de prédation. Des travaux récents réalisés au sein du laboratoire ont montré que le système Kil est indispensable au recrutement du T3SS*, suggérant l’existence d’un lien fonctionnel étroit entre ces deux nanomachines dans le processus d’intoxication de la proie (Herrou J et al. 2025 Nat. Commun.).

Cependant, les mécanismes moléculaires reliant ces deux systèmes restent à être caractérisés. En particulier, l’identité des effecteurs toxiques impliqués dans la prédation ainsi que les mécanismes permettant leur sécrétion et leur action au niveau de la proie sont inconnus.

Dans ce contexte, les deux objectifs principaux du projet sont :

1. Caractériser, par des approches in silico, in vivo et in vitro, le lien fonctionnel entre les systèmes Kil et T3SS*.
2. Identifier et caractériser les effecteurs moléculaires impliqués dans la prédation de la proie.

Ces travaux permettront de mieux comprendre les mécanismes moléculaires et cellulaires responsables de l’intoxication et de la lyse contact-dépendante des bactéries proies.

Activités :
• Assurer une veille scientifique et technique dans les domaines de la microbiologie, de la biologie cellulaire, de la biologie moléculaire et de la biochimie des protéines.
• Participer à la planification et à la conception des expériences, ainsi qu’au suivi des différentes étapes du projet.
• Mettre en œuvre des approches de biologie moléculaire : conception d’amorces, PCR, clonage, construction de plasmides et remplacement allélique.
• Générer des mutants de M. xanthus afin de caractériser la fonction et l’importance de protéines candidates du système Kil et du T3SS* au cours de la prédation.
• Produire et purifier des protéines recombinantes en système procaryote (E. coli) afin d’étudier les interactions protéine-protéine entre les composants des systèmes Kil et T3SS*, et de caractériser l’activité de potentiels effecteurs toxiques.
• Mettre en place et réaliser des expériences de microscopie à fluorescence afin de suivre, au cours de la prédation, le recrutement et la dynamique de protéines du Kil et du T3SS* au niveau du site de contact avec la proie.
• Mettre en place et réaliser des tests phénotypiques permettant d’évaluer l’efficacité de prédation de différents mutants de M. xanthus.
• Analyser, interpréter et documenter les
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