Ingénieur bioinformatique (H/F) en analyse intégrative de données d’interactomique
Référence : UMR9198-RAPGUE-001
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 91198 GIF SUR YVETTE (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD d'1 an
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels entre 2571€ et 2742€ bruts mensuels selon expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
La personne recrutée dans le cadre de l'ANR MachActAssembly aura pour mission de développer, mettre en œuvre et maintenir des analyses bioinformatiques pour l’exploitation de jeux de données à haut débit liés aux interactions protéine-protéine, à la protéomique quantitative aux cribles fonctionnels et aux prédictions structurales. Elle contribuera à la mise en place de pipelines reproductibles permettant d’intégrer des sources de données hétérogènes, de contrôler leur qualité, de comparer les résultats obtenus par différentes approches expérimentales ou computationnelles, et de prioriser des candidats pour des validations expérimentales. Le poste est particulièrement adapté à une personne souhaitant travailler à l’interface entre bioinformatique, biologie des protéines, interactomique, protéomique et modélisation structurale.
Activités :
La personne recrutée sera amenée à :
• développer des scripts et pipelines d’analyse reproductibles pour des données biologiques à haut débit
• analyser des jeux de données d’interactions protéine-protéine issus de cribles expérimentaux
• exploiter des sorties d’outils de modélisation structurale, notamment des prédictions d’interactions protéine-protéine et de design des interfaces de complexes
• mettre en place des scores de confiance et des stratégies de priorisation de candidats
Contexte de travail :
La personne recrutée travaillera à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), à Gif-sur-Yvette, dans un environnement fortement interdisciplinaire associant bioinformatique, biologie structurale, biologie moléculaire et analyse de données à haut débit. L’I2BC rassemble de nombreuses expertises en biologie computationnelle et expérimentale et offre un cadre scientifique particulièrement stimulant au sein du campus Paris-Saclay. Des échanges réguliers avec les partenaires de l'ANR MachActAssembly du projet seront prévus. Le poste nécessitera principalement un travail sur ordinateur avec des réunions scientifiques et techniques régulières.
Profil recherché
Competences :
• bonne maîtrise de Python
• connaissance des méthodes de deep learning (librairie PyTorch)
• expérience en analyse de données biologiques à grande échelle
• maîtrise d’un environnement Linux
• utilisation de Git pour le suivi de versions
• connaissances en statistiques appliquées aux données biologiques
• langue anglaise : B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)
Contraintes et risques :
Le poste ne présente pas de contrainte particulière en dehors du travail habituel sur ordinateur.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en biologie - SVT
