Ingénieur d'études en biologie moléculaire (H/F)
Référence : UMR5535-SARADE-076
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 34293 MONTPELLIER (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels A partir de 2491.65€ brut mensuel, ajustable selon expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
À l'IGMM, notre groupe Réseaux intégratifs des ARNs dans le développement s'intéresse à l'étude de la fonction des facteurs de transcription (FT) dans la biogénèse des ARNm et sa contribution à l'identité cellulaire. Ce projet financé par l'AFM Téléthon (projet ISOFHORM) vise à redéfinir le rôle des facteurs de transcription dans la morphogénèse musculaire. Le projet consiste à cartographier les réseaux d'épissage régulés par Ultrabithorax (Ubx), un facteur de transcription Hox de drosophile et à déterminer sa fonction isoforme-spécifique au cours du développement du muscle embryonnaire de drosophile.
L'ingénieure ou ingénieur aura en charge un projet basé sur la détection, l’analyse et la validation de profiles d’épissage et d’isoformes régulés par Ubx au cours du développement du muscle embryonnaire. Cela consiste en l’établissement de protocoles pour la purification d’ARN compatible en séquençage Illumina (short-read) et nanopore (long-read), puis l’analyse de profiles d’épissage et d’isoformes par transcriptomique (bioinformatique) ainsi que la validation fonctionnelle de ces isoformes (génétique) au cours du développement musculaire, et ce de manière indépendante (60%).
La personne apportera un support sur la biologie moléculaire et biochimie de complexes protéine-ARN in vitro (20%).
La personne contribuera à l’établissement et maintenance de lignées de drosophiles (10%) et à la veille des protocoles et la gestion des stocks de l’équipe (10%).
Contrat initial de 6 mois, avec possibilité de renouvellement.
Activités :
Effectuer des expériences in vivo chez la Drosophile
-Entretenir des lignées et croisements, embryon collections, fixation, immunomarquage et microscopie confocale
-Mettre en place un protocole de purification biochimique d’ARNs nucléaires pour l’analyse de transcriptomes différentiels à partir de muscle embryonnaire de drosophile par séquençage Illumina (short-read) et Nanopore (long-read)
-Valider des cibles par méthodes alternatives (qPCR, smFISH, expression exogène d’isoformes)
Effectuer des expériences in vitro
-Appliquer des techniques de clonage, biochimie des protéines et ARNs (SDS-PAGE, WBlot, RT-qPCR, RNA-IP)
Effectuer des analyses bioinformatiques
-Développer et implémenter les outils bioinformatiques en collaboration avec les plateformes et collaborateurs
-Analyser les profils d’épissage à partir de data de séquençage Illumina (short-read) et Nanopore (long read)
-Réaliser des analyses informatiques de données incluant les analyses statistiques
Responsabilités
-Choisir et adapter des technologies en fonction des objectifs discutés en amont
-Développer et rédiger des protocoles et des rapports structurés en anglais
-Traiter et analyser les données, mettre en forme les résultats pour leur présentation en anglais
-Transmettre ses connaissances et compétences dans son domaine d'étude
-Participer à la diffusion et à la valorisation des résultats sous
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...
Profil recherché
Competences :
-Bac +3 ou plus en biologie moléculaire, cellulaire, biochimie, biotechnologies ou disciplines similaires.
Savoirs / connaissances
-Connaissances en transcriptomique, biochimie, biologie moléculaire
-Connaissance de base sur les méthodes de détection de l'épissage des ARNs
-Capacité orale et écrite à communiquer en anglais (équivalent de niveau C1)
-Connaissance appréciée en génétique de la drosophile ou analyse bioinformatique de transcriptome
Savoir-faire
-Excellentes compétences en biologie moléculaire (clonage, PCR, production d'ADN, purification, western-blot, purification des ARNs pour séquencage)
-Excellentes compétences dans une (ou plusieurs) des catégories suivantes : méthodes de biochimie liées aux ARNs, transcriptomiques ou génétique de la Drosophile
-Compétences de base en imagerie confocale
-Bonnes compétences informatiques (excel, word, powerpoint)
-Une expérience dans l'analyse de donnée transcriptomique sera appréciée
Savoir-être
-Capacité à travailler de manière indépendante sur les pipelines discutés
-Forte curiosité d'apprendre de nouvelles techniques et contribuer aux différents projets de l'équipe
-Fort sens de l'organisation
-Rigueur sur les activités de reporting, suivi des protocoles en anglais, planning expérimentaux
-Capacité à travailler en équipe, à contribuer à la vie du laboratoire (actions communes, tâches)
-Qualités générales : Communication, Rigueur, Esprit d'équipe, Autonomie, Enthousiasme
Savoir généraux, théoriques ou disciplinaires
-Connaissance ou intérêt pour la régulation co-transcriptionnelle
-Connaissance ou expérience sur la biologie des ARNs ou du modèle Drosophile
-Connaissance ou motivation pour participer aux analyses bioinformatiques est essentielle
Contraintes et risques :
Possibilité de venir certains week-ends et jours fériés pour entretien et collection des échantillons vivants (1 à 2h max le week-end)
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
