Ingénieur de recherche en bio-informatique H/F
Référence : UMR5217-GLOIAC-004
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 38058 ST MARTIN D HERES (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD de 2 ans
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels À partir de 3 143,64 €, selon l’expérience et la grille salariale en vigueur € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Le cancer est une maladie hétérogène, chaque tumeur évoluant comme un système multicellulaire autonome. L'écosystème tumoral est constitué de cellules d'origines et d'identités différentes qui interagissent dynamiquement les unes avec les autres. Il est difficile d'observer et de quantifier l'hétérogénéité de la composition tumorale, un facteur clé contribuant à la progression du cancer.
Notre incapacité actuelle à estimer l'hétérogénéité dans un échantillon donné a entravé notre compréhension de sa fonction au cours des processus oncogènes.
L'ingénieur.e recruté.e contribuera au développement de nouvelles méthodes scientifiques visant à estimer l'hétérogénéité tumorale à partir de données omiques (transcriptomes et méthylomes) Il/elle participera également au maintien des outils existants (notamment en mettant en place de bonnes pratiques de biocomputing et des procédures standardisées de traitement des données).
Activités :
- Développement de méthodes biostatistiques pour l’analyse de l’hétérogénéité tumorale
- Analyse de données en cellule unique
- Management des ressources computationnelles de l’équipe (maintenance des projets en cours, formation des nouveaux arrivants, organisation des ressources de stockage et de calcul scientifique, data management)
- Veille technologique sur les développements méthodologiques en lien avec les activités de recherche de l’équipe
- Animation du réseau BIGRE
Contexte de travail :
Le Laboratoire d’Informatique de Grenoble (LIG) est un laboratoire d’envergure, dont les partenaires académiques sont : l’Université Grenoble Alpes, Grenoble INP - UGA, le CNRS et Inria.
Le LIG rassemble près de 500 chercheurs, enseignants-chercheurs, doctorants et personnels en support à la recherche. Ils relèvent des différents organismes et sont répartis sur trois sites du LIG : le campus, Minatec et Montbonnot.
L’ambition est de s’appuyer sur la complémentarité et la qualité reconnue des 22 équipes de recherche du LIG pour contribuer au développement des aspects fondamentaux de l'informatique (modèles, langages, méthodes, algorithmes) et pour développer une synergie entre les défis conceptuels, technologiques et sociétaux associés à cette discipline.
Profil recherché
Competences :
• Doctorat en bio-informatique ou biologie computationnelle ; Master en bio-informatique ou bio-statistique.
• Des compétences en programmation (R, Python, bash), une expérience préalable avec des logiciels d'analyse et les packages associés
• Des connaissances en informatique, data management et développement de projets collaboratifs
• Des connaissances en biologie
• Capacité à communiquer en anglais parlé et écrit
• Autonome et rigoureux.se avec un esprit critique, capacité à gérer et à analyser des ensembles de données volumineux et variés, avec des informations biologiques et cliniques
• Bonnes compétences en communication permettant des interactions productives avec une équipe interdisciplinaire (y compris des informaticiens, des biologistes et des cancérologues)
Contraintes et risques :
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Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
