Ingénieur d’études en techniques biologiques H/F - production et caractérisation de glycoprotéines et d

Missions :
Dans le cadre du projet ANR Chick-MUG (« Chicken Host Interactions with Salmonella, secreted Mucin, and Glycosylation »), la personne recrutée assurera principalement la préparation, la production, la purification et la caractérisation de glycoprotéines et d’oligosaccharides, notamment issus des mucines intestinales du poulet, afin d’étudier leurs interactions avec Salmonella Enteritidis.
Activités :
• Préparer, produire lorsque cela est adapté, extraire et purifier des glycoprotéines, en particulier des mucines, à partir de matériels biologiques.
• Libérer, isoler, purifier et caractériser des oligosaccharides, notamment les O-glycanes de mucines ; comparer les profils de glycosylation (fucosylation, sialylation et sulfatation).
• Mettre en œuvre et optimiser les analyses par spectrométrie de masse, notamment MALDI, et les séparations chromatographiques nécessaires à la caractérisation des glycoprotéines et oligosaccharides.
• Préparer des glycoprotéines, oligosaccharides et échantillons analytiques pour les études d’interactions avec des protéines bactériennes et pour les analyses réalisées avec les partenaires du projet.

• Développer et documenter des protocoles de production, extraction, purification et contrôle qualité des glycoprotéines ; mettre en œuvre la libération, la purification et la préparation des oligosaccharides pour les analyses structurales.
• Réaliser les analyses chromatographiques (notamment HPLC) et de spectrométrie de masse (notamment MALDI-TOF et, selon les équipements disponibles, MS/MS) ; traiter, comparer et interpréter les profils analytiques.
• Exploiter et interpréter les résultats expérimentaux, assurer leur traçabilité, préparer figures, comptes rendus, protocoles et présentations scientifiques.
• Coordonner les échanges d’échantillons et de résultats avec les partenaires du consortium et participer aux réunions du projet.
• Gérer les consommables et réactifs nécessaires aux expériences ; appliquer les procédures qualité, d’hygiène, de sécurité et de biosécurité du laboratoire.

Contexte de travail :
Le poste est basé à l’UGSF (UMR 8576 CNRS / Université de Lille), au sein de l’équipe partenaire 1 du projet Chick-MUG, sous la responsabilité scientifique de Yannick Rossez. Le consortium associe l’UGSF, l’UMR ISP 1282 (INRAE / Université de Tours), la Plateforme d’Infectiologie Expérimentale (INRAE) et Hendrix Genetics. Les travaux de l’UGSF portent notamment sur la glycomique structurale, les adhésines de Salmonella et les interactions entre glycanes et bactéries. Les analyses pourront mobiliser les équipements et plateformes accessibles à l’équipe, notamment PAGES et les infrastructures de spectrométrie de masse et de RMN. Des déplacements professionnels ponctuels à l’étranger, pouvant durer quelques semaines, sont à prévoir pour réaliser des analyses spécialisées nécessaires au projet. Leur calendrier et leur destination seront définis selon les b
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