Ingénieur développement logiciel spécialiste en neurosciences et médecine numériques (F/H)

Son activité principale s’inscrit dans le cadre de projets d’envergure sur lesquels il est affecté pour une durée donnée, le plus souvent au sein d’une ou plusieurs équipes-projets.
L’estimation, la quantification et comparaison de la dynamique cérébrale est un des défis centraux des neurosciences modernes. Le modèle de réseaux cérébraux a émergé depuis quelques années comme une représentation importante pour décrire cette dynamique cérébrale.
L’objectif de l’équipe-projet CRONOS est de développer des modèles, algorithmes et logiciels pour estimer, comprendre et quantifier la dynamique du cerveau entier.
Cet objectif sera atteint par la modélisation de l’architecture macroscopique et de la connectivité du cerveau à 3 niveaux de complexité différents :
Le niveau capteur qui est généralement de faible dimension mais contient néanmoins l’essentiel de l’information recherchée (mais souvent sous une forme peu explicite).
Le niveau source qui se rapproche de l’anatomie, donc plus explicite et interprétable, mais qui “vit” dans un espace de haute dimension (donc l’information y est souvent redondante).
Le niveau groupe qui vise à extraire des caractéristiques statistiques des signaux associés à des tâches spécifiques, ce qui permet de contraindre l’extraction d’information tant au niveau capteur qu’au niveau source.
Ces trois niveaux seront étudiés au travers de la représentation unificatrice de réseaux dynamiques, intégrant les informations dynamiques et partielles provenant de diverses modalités non-invasives d’observation du cerveau (IRMf, IRMd, EEG, MEG, …) dans un modèle global cohérent.
Les applications cibles de ces outils vont des neurosciences fondamentales, des études cognitives et cliniques aux interfaces cerveau-ordinateur. L’équipe-projet CRONOS compte élargir son impact dans ces domaines en fournissant des logiciels open source mettant en œuvre nos modèles et algorithmes de manière accessible aux utilisateurs non techniques.
La plateforme Brain/Computer-Suite est une suite logicielle (librairies et diverses applications) qui permet de faire du traitement temps-réel de séries temporelles de mesures de l’activité électro-magnétique (notamment MEG et EEG) du cerveau. Ce code est à la base de plusieurs applications avec des visées très variées:
Interfaces cerveau-ordinateur et applications de réhabilitation (Speller P300).
Applications cliniques (neurofeedback, détection de pointes épileptiques en temps réel, amélioration de la compréhension des outils utilisés en chirurgie éveillée du cerveau, etc).
Nettoyage et mise en forme de jeux de données.
La plateforme vise à une stricte séparation des algorithmes et des interfaces et se donne pour but de fournir les moyens à ses utilisateurs de faire des expérimentations reproductibles.
La première affectation au sein de cette équipe porte sur une durée de 4 ans.