Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Référence : 2026-2196723
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Nantes Université
- Localisation : Nantes Centre
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD de 6 mois
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels 33,4k à 48,37k brut/annuel € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Oui
Vos missions en quelques mots
Missions
Notre groupe a accès à des données cliniques et à plusieurs données omiques longitudinales multiples (métabolome, lipidome, protéome) pour deux grandes cohortes françaises de patients gravement malades. Les missions de l’ingénieur seront de :
· caractériser l'effet de la pneumonie sur chaque omique,
· réaliser une intégration multi-omique
· évaluer si les signatures identifiées, par exemple la reprogrammation métabolique ou lipidique, sont associées à des événements cardiovasculaires ultérieurs.
Le candidat retenu sera chargé des analyses bioinformatiques du séquençage immunologique, de l'interprétation des analyses multi-omiques et de la rédaction d'un manuscrit.
Activités principales
· Concevoir, Développer, déployer et maintenir des méthodes d’analyses de données omiques :
Faire une revue de littérature, choisir des outils, les tester, les déployer sur le cluster d’analyse, les maintenir à jour et les utiliser dans le cadre de projets de recherche en cours au sein de l’équipe.
· Analyser des données de lipidomique, métabolomique et protéomique :
Controler la qualité, nettoyer, ordonner, normaliser, comparer les données et représenter les résultats scientifiques.
· Interagir avec les autres membres de l’équipe :
Discuter des choix méthodologiques, des résultats. Acquérir les connaissances sur le contexte biologique nécessaires à chaque projet. Participer à la valorisation des résultats, dont lors de la rédaction des publications scientifiques.
RETROUVEZ LA FICHE DE POSTE EN INTEGRALITE : https://www.univ-nantes.fr/universite/recrutement/nantes-universite-recrute-un-e-ingenieur-e-biologiste-en-analyse-de-donnees-cr2ti
Profil recherché
- Formation et/ou qualification :
Doctorat (ou qualification équivalente) en bioinformatique.
Un diplôme supplémentaire en biologie serait un atour pour l’intégration translationnelle du projet.
Un très bon niveau en langage de programmation (Python ou R) est attendu.
- Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste :
Une expérience ayant permis l’acquisition d’un solide savoir-faire en bio-informatique (langages de programmation, modélisation statistique, analyse prédictive et intégration de données omiques (métabolome, protéome, microbiome, transcriptome), d’une bonne expertise en immunologie et la capacité à travailler en équipe multidisciplinaire est bienvenue.
La publication d’articles dans des journaux scientifiques reconnus en tant que principal auteur sera appréciée.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
Compétences attendues
Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires :
-Connaissances théoriques et appliquées en métabolomique, lipidomique et protéomique.
-Maitrise des principes F.A.I.R.
-Maitrise de l'anglais scientifique
Savoir-faire opérationnels :
-Garantir la qualité de l'analyses de données
-Maitriser l'environnement linux
-Maitriser les langages R et Python
-Transmettre ses résultats
-Justifier ses choix
-Organiser son travail
-Respect de la confidentialité.
Savoir-être :
-Sens aigu de l'organisation
-Sens critique constructif
-Prise d'initiatives
-Rigueur scientifique
-Relationnel respectueux et pro-actif
Localisation
Éléments de candidature
Documents à transmettre
Personnes à contacter
Qui sommes-nous ?
Nantes Université est un établissement public d’enseignement supérieur et de recherche qui propose un modèle d’université inédit en France unissant une université, un hôpital universitaire (CHU de Nantes), un institut de recherche technologique (IRT Jules Verne), un organisme national de recherche (Inserm) et des grandes écoles (Centrale Nantes, École des Beaux-Arts Nantes Saint-Nazaire, École d’Architecture de Nantes).
Ces acteurs concentrent leurs forces pour développer l’excellence de la recherche nantaise et offrir de nouvelles opportunités de formations, dans tous les domaines de la connaissance.
Durable et ouverte sur le monde, Nantes Université veille à la qualité des conditions d’études et de travail offertes à ses étudiantes, étudiants et personnels, pour favoriser leur épanouissement sur tous ses campus de Nantes, Saint-Nazaire et La Roche-sur-Yon.
À propos de l'offre
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Environnement de travail :
· Bureau partagé
· Travail en équipe
Rythme de travail :
· Horaires fixes ou variables
· Contraintes calendaires
Conditions de travail :
· Usage d’un écran
· Utilisation d’applications métiers
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Vacant à partir du 16/03/2026
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Experte / Expert en biologie - SVT