Ingénieur-e calcul scientifique et imagerie 3D H/F

Vous serez impliqué-e dans :
(i) le développement de stratégies de gestion des données 3D, de reconstruction de structures 3D et surtout de calcul fonctionnel sur ces structures pour en extraire des paramètres physiques et biologiques pertinents ;
(ii) le développement d'approches de combinaison multiéchelle de structures, avec des modes d'interpolation par homogénéisation à partir d'un échantillonnage d'images aux petites échelles ;
(iii) la caractérisation de la cinématique 3D de ces structures, pour comprendre leur plasticité phénotypique ;
(iv) la participation, avec notre ingénieur en modélisation et avec les chercheurs concernés, au développement de nouveaux modèles de fonctionnement à structure 3D dynamique.
Vous animerez l'équipe transversale « Ingénierie Imagerie Informatique Automatique et Modélisation » (I3AM) en encadrant un groupe d'ingénieurs et de techniciens (4 permanents +des contractuels). A ce titre, vous interagirez aussi fortement avec les scientifiques et la direction de l'unité, ainsi qu'avec les réseaux imagerie d'INRAE et de INRIA.
Vous contribuerez à l'essor d'une chaîne d'analyse 3D combinant imagerie tissulaire (Nanotomographie 3D RX et/ou SPIM) et à la caractérisation de la structure de l'organe ou de la plante ( par vision 3D et/ou LIDAR terrestre), pour des applications de thermique, de mécanique et d'hydraulique des plantes.
Vous serez chargé-e de piloter et de contribuer aux activités de l'UMR PIAF relatives aux développements numériques et à l'analyse en imagerie 3D.
Vous viendrez en conseil et collaboration auprès des scientifiques dans le choix des méthodes numériques sur des problèmes de modélisation 3D et en soutien sur la mise en oeuvre pratique de ces méthodes.
Vous serez inséré-e dans les réseaux d'animation autour de l'imagerie 3D, et pourrez aussi participer à des projets collectifs hors unité. En effet, notre équipe d'ingénierie transversale est ouverte à de telles approches mutualisées.
L'animation de l'équipe transversale I3AM revêt une importance stratégique pour l'UMR, en développant un mode de fonctionnement mutualisé entre les équipes et en collaboration avec les collègues extérieurs, mais aussi avec les scientifiques et la direction de l'Unité.
Enfin vous serez impliquée-e fortement dans les animations du département AgroEcoSystem autour de l'imagerie 3D et dans le PEPI (Partage d'Expériences et de Pratiques en Informatique) MACS (Mathématiques Appliquées et Calcul Scientifique).