Ingénieur-e en biologie

L'activité s'exercera au sein de l'unité de recherche MycSA qui regroupe environ vingt-cinq chercheurs, ingénieurs et techniciens qui œuvrent pour décortiquer les réseaux d’interactions qui résultent en une accumulation de mycotoxines dans les grains de maïs. Dans le cadre d’un projet collaboratif et sous la responsabilité d’une chercheur (Nadia Ponts), vous aurez pour mission de mener à bien des expérimentations de microbiologie et de biologie moléculaire permettant de déchiffrer la dynamique des évènements moléculaires qui caractérisent les modes de vie endophyte ou pathogène du champignon Fusarium verticillioides producteur de fumonisines sur épi de maïs. Pour cela, vous serez amenés à mettre en culture F. verticillioides en conditions contrôlées, extraire les acides nucléiques à partir d’échantillons microbiologiques, puis de préparer les librairies de type NGS (par PCR) qui serviront à explorer la régulation de l’expression des gènes. Dans ce cadre, vous mettrez en œuvre les expérimentations permettant de quantifier et de contrôler la qualité des échantillons (acides nucléiques et banques NGS). Enfin, vous analyserez vos résultats pour les présenter lors de réunions scientifiques.Vous serez plus particulièrement en charge de :La mise en œuvre des cultures de champignons et la collecte des échantillons biologiques, y compris en milieu confiné (sécurité biologique niveau 2)L’extraction d’acide nucléiques (majoritairement ARNs)Les contrôles qualitatifs (électrophorèse traditionnelle ou automatisée à capillaires) et quantitatifs (dosages des acides nucléiques ou par qPCR) en cours et à la fin de chaque expérimentationLa communication avec les autres membres du projet