Ingénieur-e en calcul scientifique pour les systèmes dynamiques H/F

L'unité MISTEA (Mathématiques Informatique et Statistiques pour l'Environnement et l'Agronomie), dont l'effectif compte 55 personnes, est structurée en trois axes : « Systèmes Dynamiques », « Probabilités-Statistique » et « Informatique ».
Vous serez intégré-e dans l'axe « Systèmes dynamiques » (11 personnes) qui regroupe les scientifiques dont les travaux de recherche portent sur la modélisation, la simulation et l'analyse des agro-écosystèmes au moyen de systèmes dynamiques déterministes et stochastiques. Ces scientifiques contribuent également au développement de méthodes mathématiques pour l'optimisation et la commande des agro-écosystèmes. L'axe s'intéresse depuis longtemps à l'écologie microbienne (fermentation alcoolique, traitement des eaux, populations algales), et s'investit également dans le domaine de l'agroécologie (systèmes d'élevage et/ou de culture) pour lequel il est de plus en plus sollicité (#DigitAg, #3Perf).
Vous viendrez compléter et renforcer les compétences en calcul scientifique dans l'axe. Plus précisément, vos missions consisteront à :
1) gérer, mutualiser, partager et valoriser des résultats de travaux de recherche sous une forme logicielle diffusable, c'est-à-dire : maintenable, disposant d'une interface utilisateur, déployable, etc. Vous devrez mener une réflexion sur la stratégie de diffusion et de partage des données et codes, en concertation avec les scientifiques de l'axe et de l'unité. En interne, la mise en place d'une base de données de scripts est une solution qui pourrait être envisagée. En externe, la diffusion des codes et outils se fera via le développement de packages, ou d'interfaces graphiques « user-friendly » utilisables par nos partenaires applicatifs (écologues, agronomes, biologistes...). S'ils ont vocation à être réutilisés régulièrement, les codes et outils numériques devront être génériques et pérennes et feront l'objet d'une maintenance (corrective, adaptative et évolutive) que vous effectuerez.
2) développer des codes de calculs performants et pérennes dans des langages tels que Python, JAVA, C++. Les codes devront notamment avoir des temps d'exécution raisonnables, ce qui passe par l'optimisation et la parallélisation mais aussi par la transcription dans des langages plus performants (passage de R, matlab, python, à C++ ou fortran notamment). La création de packages fera aussi partie de vos missions.
3) développer des codes et outils de calcul scientifique de qualité dédiés à l'implémentation de modèles, la simulation ou encore l'optimisation. Il s'agira d'implémenter des méthodes déjà opérationnelles, classiques ou issues de travaux de recherche récents développés dans l'axe ou ailleurs et de les mettre en oeuvre. La création de codes pour l'installation et l'utilisation de logiciels de simulation spécifiques fera également partie de vos missions.