Ingénieur-e en Immunologie

Activités principales

·       Isolement des cellules épithéliales thymiques médullaires (mTEC) à partir d’échantillons de thymus humains obtenus en chirurgie cardiaque. Mise en œuvre de la stratégie d’isolement par digestion mécanique et enzymatique, sélection par billes magnétiques (CD45- EpCAM+) et tri cellulaire FACS (CD205- HLA-DR+). Isolement des sous-populations mTEC high (AIRE+ MHC-II high) et mTEC low à partir d’environ 35 donneurs (105 échantillons au total).

 ·       Préparation des librairies de RNA-seq total à partir des mTEC isolées en utilisant le kit SMARTER stranded total RNA-seq. Culture et transfection de la lignée cellulaire mTEC 4D6 avec un vecteur d’expression AIRE pour générer des cellules 4D6-AIRE+. Préparation d’échantillons pour le séquençage RNA-seq total (short et long reads) et le ribo-seq.

 ·       Analyse par cytométrie en flux (FACS) et immunofluorescence des populations cellulaires isolées. Gestion des réactifs, consommables et matériels nécessaires au projet. Contribution à la rédaction de rapports d’avancement et à la valorisation des résultats (publications, présentations).

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