Ingénieur(e) d'étude en bioinformatique (H/F)
Référence : UMR7621-FRABOU-003
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 66651 BANYULS SUR MER (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD d'1 an
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Entre 2496 et 3817, 32 € brut /mois selon expérience. € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Nous recrutons un ingénieur (H/F) en bioinformatique. Ce projet concerne la caractérisation du Pan Génome de la microalgue phytoplanctonique Bathycoccus prasinos pour identifier dans l'océan, la structure des populations et les mécanismes d’adaptation à l’échelle spatio-temporelle.
Activités :
L’activité principale consistera à assembler des données de séquençage issues de la technologie Oxford Nanopore d'une collection d’environ 150 génomes, puis à les intégrer dans des outils d’analyse et de visualisation du Pan génome.
Une seconde mission portera sur l’identification de marqueurs d’insertion/délétion (ins/del) propres aux différentes populations, suivie de leur cartographie sur des jeux de données de métagénomique et de métatranscriptomique environnementales de l'océan mondial.
Contexte de travail :
Le poste est à pourvoir au Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC), situé à Banyuls-sur-Mer. L’activité se déroulera également au laboratoire DIADE situé à Montpellier, dans le cadre d’une collaboration menée via un projet financé par l’Agence Nationale de la Recherche.
Le LOMIC est reconnu comme un acteur majeur dans l’étude de la biologie et de l’écologie du picophytoplancton eucaryote. Le laboratoire DIADE, quant à lui, est pionnier dans le domaine des analyses pangénomiques et met à disposition des infrastructures informatiques de pointe, indispensables à la bonne conduite du projet.
Profil recherché
Competences :
Formation : Master en bioinformatique ou diplôme équivalent.
Le/La candidat(e) devra posséder de solides compétences en bioinformatique et en programmation (notamment en Python). Une expérience en assemblage et analyse de génomes, ainsi qu’en construction et analyse de Pan génomes, serait fortement appréciée.
Des qualités telles que la capacité d’adaptation, le sens du travail en équipe, la rigueur et l’autonomie sont également essentielles. La maîtrise de l’anglais scientifique est indispensable, tant pour la rédaction de rapports que pour les communications orales.
Contraintes et risques :
aucune
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
