Ingénieur(e) d'étude en Bioinformatique
Référence : 2026-2240606
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
-
Employeur :
Université Côte d'Azur
Université Côte d'Azur - Localisation : sophia Antipolis
Partager la page
Veuillez pour partager sur Facebook, Twitter et LinkedIn.
- Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
- Expérience souhaitée Non renseigné
-
Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A+ (Encadrement supérieur - Autres emplois fonctionnels)
- Management Non
- Télétravail possible Non
Vos missions en quelques mots
Missions
- Analyse bioinformatique de données transcriptomique (bulk, long-reads, single-cell RNAseq et spatiale) dans le cadre de projets provenant des équipes CNRS pour l’axe consacré à l’exploitation des données complexes et au développement de l’intelligence artificielle appliquée à la santé respiratoire de l’IHU RespirERA.
- Mise en œuvre et amélioration de pipelines d'analyse déjà existants dans l'équipe. Si nécessaire, développement de nouveaux pipelines.
- Veille technologique afin d'évaluer de nouveaux pipelines.
- Exploration et exploitation des données dans le but d’écrire des articles scientifiques.
Activités :
- Choisir et adapter les pipelines d'analyse transcriptomiques sur cellule unique et en « bulk RNAseq » ainsi qu’en transcriptomique spatiale aux questions biologiques posées par l'équipe de recherche.
- Analyser les résultats provenant des chercheurs de l'équipe et les replacer dans le contexte des résultats obtenus par d'autres équipes.
- Gérer les projets conjointement avec les chercheurs et doctorants de l'équipe.
- Rédiger des rapports d'expérience.
- Participer à la veille scientifique et technologique sur les analyses de données transcriptomique.
Profil recherché
Compétences attendues
Connaissances en analyse transcriptomique
Biologie (connaissance approfondie)
Notions opérationnelles d'anglais
Mettre en œuvre des pipelines d'analyse transcriptomique sous R
La maitrise de Python est un plus
Aptitude à la communication orale et écrite (français/anglais)
Capacité à travailler en étroite collaboration avec les différents collaborateurs du projet.
Contexte de travail
Le poste est à pourvoir au sein de l'Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire à Valbonne – Sophia Antipolis (Alpes Maritimes). L'IPMC regroupe 20 équipes de recherche et des services communs pour un effectif global de plus de 220 personnes. La personne recrutée travaillera dans le cadre du hub de bioinformatique CoBioDa en interaction avec les 3 équipes associées à l’IHU respirERA : « Physiologie Génomique des Eucaryotes » (Pascal Barbry), « Mécanique cellulaire de l’échelle moléculaire à l’échelle tissulaire » et « Génome non-codant et pathologies pulmonaires ». Elle travaillera également de manière étroite avec la plateforme de génomique de l'IPMC, UCAGenomiX.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 4 Baccalauréat
Qui sommes-nous ?
Université Côte d’Azur est un grand Établissement Public à Caractère Scientifique Culturel et Professionnel dont les missions fondamentales sont la Formation des étudiantes et des étudiants et des professionnelles et professionnels, une Recherche d’excellence et une Innovation au service de tous et toutes. Depuis le 1er janvier 2020, cet établissement public expérimental vise à développer le modèle du 21ème siècle pour les universités françaises, basé sur de nouvelles interactions entre les disciplines (pluridisciplinarité et transdisciplinarité), avec une volonté de dynamique collective articulant Formation-Recherche-Innovation, ainsi que de solides partenariats locaux, nationaux et internationaux avec les secteurs public et privé.
À propos de l'offre
-
Vacant à partir du 02/04/2026
-
Experte / Expert en information statistique