Le poste vise à développer et intégrer de nouveaux composants IA (LLMs, RAG, GraphRAG, embeddings, agents, MCP, NLP) afin de créer une nouvelle génération de services intelligents autour des ontologies, graphes de connaissances et données FAIR.

Nous recherchons un profil informatique polyvalent, curieux et expérimentateur, capable de travailler à l’interface entre développement Web, IA générative et Web sémantique. Vous travaillerez au sein de l’équipe de recherche MISTEA à Montpellier.

Informations clés

Employeur : INRAE

Durée : CDD de 24 à 36 mois à partir de juin 2026

Lieu : Montpellier — Campus Institut Agro La Gaillarde (unité MISTEA)

Teletravail :  Jusqu'à 3 jours par semaine

Type de poste :   Ingénieur d’étude en CDD (REFERENS E2C45)

Rémunération :  2200€ à 3200€ brut/mois selon expérience  

Avantages :  30 jours de congés + 15 jours de RTT/an, horaires flexibles, environnement international et open source, perspectives de prolongation possibles 

Profil :  Bac+5 (Master ou école d’ingénieur) en informatique ou science des données / IA

Experience:  0 a 3 ans d'expérience; diplôme niveau Master ou Ingénieur en Informatique

Contexte

Les ontologies, vocabulaires et terminologies sont aujourd’hui essentiels pour rendre les données scientifiques interopérables et réutilisables selon les principes FAIR.

AgroPortal (https://agroportal.eu) est une plateforme de référence pour l’hébergement, la recherche, la visualisation et l’exploitation d’artefacts sémantiques dans les domaines de l’agriculture, de l’alimentation et de l’environnement. La plateforme héberge aujourd’hui plusieurs centaines de ressources utilisées par des communautés scientifiques et techniques internationales.

Le projet s’inscrit dans l’écosystème open source OntoPortal (https://ontoportal.org), une initiative internationale réunissant plusieurs institutions académiques et infrastructures de recherche qui mutualisent leurs développements autour d’une technologie commune de catalogues d’artéfacts sémantiques.

Les plateformes OntoPortal hébergent une grande quantité de connaissances structurées (ontologies, vocabulaires, alignements, annotations, projets, agents, notes, etc.) qui restent souvent difficiles à exploiter directement pour les utilisateurs non spécialistes du Web sémantique. L’objectif du poste est de faire émerger une nouvelle couche de services intelligents au-dessus des plateformes existantes. Les avancées récentes en IA générative ouvrent de nouvelles possibilités : 

• l’interrogation des plateformes en langage naturel (assistants IA, chatbots) 
• l’exploration conversationnelle des ontologies,
• la recommendation d’ontologies et de termes,
• la génération de requêtes SPARQL,
• l’annotation de données textuelles et extraction terminologique,
• l’alignement d’ontologies,
• l’enrichissement automatique des ontologies, génération de connaissances,
• l’exploitation des APIs OntoPortal (MCP) par des agents IA.

Vous contribuerez directement à une infrastructure utilisée dans des projets européens et internationaux autour des données scientifiques, de l’IA et du Web sémantique.

Référentiels techniques :

• GitHub AgroPortal: https://github.com/agroportal
• GitHub OntoPortal:  https://github.com/ontoportal 

Mission

Au sein d’une petite équipe technique et scientifique (3–4 personnes), vous participerez activement au développement et à l’évolution d’AgroPortal et OntoPortal avec un focus sur les questions d’IA. Vos missions incluront notamment :

• Concevoir des architectures RAG et GraphRAG adaptées aux graphes de connaissances RDF et aux ontologies
• Développer des assistants conversationnels exploitant les APIs OntoPortal
• Expérimenter embeddings, vector search et retrieval hybride
• Concevoir des workflows agents / MCP / LLMs
• Développer des services IA autour de l’annotation sémantique, l’alignement d’ontologies, la génération SPARQL, l’extraction terminologique, l’aide à la curation et l’enrichissement d’ontologies, etc.
• Intégrer des composants IA dans les plateformes existantes
• Concevoir widgets et assistants intégrés aux portails

Plusieurs prototypes existent déjà dans l’écosystème OntoPortal, notamment : ontoportal-mcp, ontoportal-rag, ainsi que différentes expérimentations autour de Dify, LangChain, GraphRAG, annotation assistée par LLMs et génération de mappings d’ontologies. Des travaux de recherche sont en cours également sur la représentation sémantique des "variables scientifiques" (représentation formelle et non ambiguë permettant la standardisation, l'interopérabilité, et la réutilisabilité des données scientifiques ainsi que l’automatisation de leur traitement/exploitation) et leur exploitation avec des approches d’IA hybride. 

Le poste consiste précisément à transformer ces prototypes et explorations en composants plus robustes, intégrés et réutilisables dans les plateformes.

Plus généralement vos missions incluront également: 

• Collaborer avec des partenaires scientifiques et techniques internationaux
• Contribuer aux développements open source d’OntoPortal
• Participer aux choix techniques et à l’évolution de l’architecture logicielle
• Encadrer ponctuellement des stagiaires ou étudiants

Stack technique

Développement Web

• Ruby / Ruby on Rails
• Hotwire
• HTML / CSS / SCSS / Bootstrap
• JavaScript (Stimulus, jQuery)
• Sidekiq
• Redis

Données & Web sémantique

• RDF
• SPARQL
• OWL / SKOS
• Triple stores / bases de graphes

IA

• Python
• LLMs 
• RAG / GraphRAG
• Embeddings
• Transformers (Hugging Face)
• LangChain / LlamaIndex / Haystack
• MCP (Model Context Protocol)

Outils & environnement

• Docker
• GitHub
• CI/CD
• APIs REST
• Développement open source collaboratif