Post-doc en génomique des populations H/F
Référence : 2024-1607947
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
- Localisation : Beaucouzé 49070
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD de 3 ans
- Expérience souhaitée Débutant
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non
Vos missions en quelques mots
- Vous serez accueilli(e) au sein de l’UMR IRHS (Institut de Recherche en Horticulture et Semences), sur le site INRAE d’Angers, dans l’équipe ResPom (Résistance du pommier et du poirier aux bioagresseurs. L’équipe ResPom s'intéresse à l'immunité du pommier et du poirier face à leur cortège de bioagresseurs. L'équipe rassemble des compétences en génétique, pathologie, biologie moléculaire et cellulaire et statistiques, et compte 18 permanents et 9 CDD et doctorants.
L’équipe ResPom est engagée dans le projet européen FruitDiv (www.fruitdiv.eu) dont un des objectifs est la caractérisation génétique des espèces apparentées sauvages des pommiers, poiriers, abricotiers, amandiers, cerisiers, et pruniers, en vue d'établir des collections ex situ représentatives de la diversité sauvage et d'identifier des populations naturelles clé à préserver in situ. Cette caractérisation sera basée sur le re-séquençage en courts fragments qui permettra d'identifier des marqueurs de type SNP (Single Nucleotide Polymorphism). Ces données seront utilisées pour étudier la diversité génétique, sa structure et les flux de gènes entre populations et avec les espèces cultivées. Elles serviront également pour rechercher des loci associés à l'adaptation locale.
- Vous serez plus particulièrement en charge de :
- Définir le pipeline d'analyse permettant d'obtenir les données de génotypage à partir des résultats de reséquençage et le mettre en œuvre pour les espèces apparentées au poirier
- Définir les méthodes à mettre en œuvre dans les analyses de génétique des populations afin de définir les limites entre espèces, d'évaluer l'ampleur de la diversité génétique et la structure des populations et d'estimer les flux de gènes au sein de chaque espèce et entre les espèces sauvages et l'espèce cultivée apparentée ; réaliser ces analyses pour les espèces apparentées au poirier
- Définir les méthodes à mettre en œuvre pour construire des core-collections qui rassemblent un maximum de diversité et en tenant compte de la structure génétique en utilisant les données de génotypage ; construire une core-collection pour les espèces apparentées au poirier
- Conditions particulières d’activité : aucune
Profil recherché
- Formation recommandée : Doctorat
- Connaissances souhaitées : Connaissances en génétique des populations ; Connaissances en bio-informatique ; Goût pour la programmation et le traitement de données ; Maîtrise de l’anglais
- Expérience appréciée : expérience dans la manipulation de grands jeux de données
- Aptitudes recherchées : Capacité d’organisation, de planification ; autonomie ; Rigueur scientifique, esprit d’analyse et de synthèse
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Productions végétales, cultures spécialisées et protection des cultures (horticulture, viticulture, arboriculture fruitière...)
Langues
- Anglais Avancé ou indépendant
Éléments de candidature
Documents à transmettre
Personnes à contacter
Qui sommes-nous ?
NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE
Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.
Notre Mission ?
Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.
Pour répondre à ces grands enjeux mondiaux, nous avons besoin de renfort dans nos équipes. Des métiers de la recherche aux métiers de l’appui, l’INRAE recrute à tout niveau de diplôme (du CAP/BEP à Bac+8) !
Rejoignez une communauté engagée et agissez pour l’intérêt général !
À propos de l'offre
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En rejoignant INRAE, vous pourrez bénéficier selon le type de contrat :
- jusqu’à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.
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Vacant à partir du 01/08/2024
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Experte / Expert en expérimentation et production végétale
