Post-doc en mycobactériologie (H/F)

Missions :
L’objectif principal de ce travail consistera identifier de nouveaux récepteurs impliqués dans la reconnaissance phagique mais aussi d’identifier d’éventuels gènes impliqués dans les étapes tardives du processus infectieux afin de mieux décrypter les interactions entre phages et mycobactéries. La compréhension de ces mécanismes permettra d’améliorer notre connaissance des déterminants de la spécificité phage-hôte et pourrait, à plus long terme, contribuer à l’optimisation de nouveaux cocktails phagiques et au développement de nouvelles stratégies de phagothérapie.
Activités :
Le projet consistera à caractériser plusieurs phages à partir de l’environnement et à déterminer leur spectre d’hôte sur une collection de souches cliniques de Mycobacterium abscessus. L’efficacité et la spécificité de lyse de ces phages seront évaluées in vitro, en présence ou en absence d’antibiotiques, afin d’étudier d’éventuelles interactions synergiques entre phagothérapie et antibiothérapie. Dans un second temps, des mutants bactériens résistants à certains phages seront générés à partir de souches sensibles. L’analyse génomique de ces mutants permettra d’identifier le ou les gènes impliqués dans la résistance phagique et d’identifier des gènes bactériens nécessaires aux étapes précoces et/ou tardives de l’infection par le phage.
Contexte de travail :
La quasi-totalité des équipements et plateformes nécessaires à la réalisation du projet sont disponibles au laboratoire ou sur le site. La plupart des expériences seront réalisées dans un laboratoire de confinement de niveau 2.