Technicien (H/F) en biologie moléculaire et virologie moléculaire
Référence : UMR5290-FRETHO-018
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 34394 MONTPELLIER (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD d'1 an
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels À partir de 2 190,43 € brut mensuel, ajustable selon l’expérience professionnelle sur des fonctions € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie B (profession intermédiaire)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Dans le cadre du projet ZOOCAM, la personne recrutée participera aux travaux du WP1 consacrés à la détection et à la caractérisation de virus présents chez différentes espèces de mammifères.
Sa mission principale sera de rechercher différentes familles virales à partir d’échantillons fécaux de mammifères déjà collectés sur le terrain, en combinant des approches de biologie moléculaire ciblées et, selon les besoins du projet, des approches de séquençage haut débit et de métagénomique virale.
La personne recrutée contribuera à l’ensemble de la chaîne expérimentale, depuis la préparation des échantillons et l’extraction des acides nucléiques jusqu’à la préparation des échantillons pour séquençage et à l’organisation des données produites.
Activités :
Les activités principales seront les suivantes :
• Inventorier, organiser et préparer les échantillons biologiques destinés aux analyses moléculaires.
• Réaliser l’extraction d’ADN et d’ARN à partir d’échantillons fécaux de mammifères.
• Mettre en œuvre et, si nécessaire, optimiser des protocoles de PCR, RT-PCR et PCR quantitative.
• Rechercher différentes familles de virus au moyen d’approches ciblées utilisant des amorces spécifiques ou à spectre large.
• Mettre en place les contrôles positifs et négatifs nécessaires à la validation des analyses.
• Réaliser les étapes de visualisation, purification et préparation des produits d’amplification.
• Préparer les échantillons destinés au séquençage.
• Participer à la mise en œuvre d’approches de séquençage haut débit et de métagénomique virale.
• Participer, selon les protocoles retenus, aux étapes de préparation de librairies pour séquençage.
• Contrôler la qualité et la concentration des acides nucléiques et des préparations destinées au séquençage.
• Assurer une traçabilité rigoureuse des échantillons, des manipulations et des résultats.
• Saisir, organiser, archiver et documenter les données expérimentales.
• Participer à l’analyse préliminaire et à l’interprétation des résultats obtenus en interaction avec les chercheurs impliqués dans le projet.
• Contribuer à l’amélioration et à la standardisation des protocoles utilisés dans le WP1.
• Respecter les règles de qualité, d’hygiène et de sécurité applicables au laboratoire.
Contexte de travail :
Contexte de travail
Le recrutement s’inscrit dans le cadre du WP1 du projet ZOOCAM, consacré notamment à la caractérisation des microorganismes et agents infectieux présents chez différentes espèces de mammifères, dans une approche à l’interface entre écologie, santé animale et santé environnementale.
La personne recrutée intégrera une équipe de recherche pluridisciplinaire associant notamment écologie, biologie évolutive, microbiologie, virologie et biologie moléculaire.
Les échantillons fécaux destinés à l’étude ont déjà été collectés. Le travail sera donc essentiellement réalisé au laboratoire (parfois en laboratoire de niveau 3*) et portera s
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...
Profil recherché
Competences :
Connaissances
• Bonnes connaissances en biologie moléculaire.
• Connaissances des principes d'extraction et d'analyse des acides nucléiques.
• Bonne connaissance des techniques de PCR et RT-PCR.
• Connaissances en virologie moléculaire appréciées.
• Connaissances des principes du séquençage haut débit et de la métagénomique souhaitées.
• Connaissance des problématiques liées aux contaminations dans les analyses d'échantillons environnementaux ou biologiques complexes.
• Notions concernant les risques biologiques et les règles de sécurité en laboratoire.
Compétences opérationnelles
• Réaliser des extractions d'ADN et d'ARN à partir d'échantillons biologiques complexes.
• Mettre en œuvre de manière autonome des protocoles de PCR et RT-PCR.
• Manipuler avec rigueur des séries importantes d'échantillons.
• Utiliser les équipements courants d'un laboratoire de biologie moléculaire.
• Mesurer et contrôler la qualité et la quantité des acides nucléiques.
• Participer à la préparation d'échantillons
• Respecter strictement les procédures permettant d'éviter les contaminations croisées.
Profil recherché
Formation souhaitée : niveau Bac +2 en biologie, biologie moléculaire, biotechnologies, microbiologie, virologie ou domaine équivalent.
Une expérience pratique en biologie moléculaire, notamment en extraction d'acides nucléiques et en PCR/RT-PCR, est indispensable.
Une expérience en virologie moléculaire, ou en analyse d'échantillons issus de la faune sauvage constituera un atout important.
Une expérience préalable de manipulation d'échantillons fécaux, environnementaux ou d'autres matrices biologiques complexes sera également appréciée.
• Tenir un cahier de laboratoire et assurer la traçabilité des expériences.
• Organiser, enregistrer et archiver les données expérimentales.
• Utiliser les outils informatiques courants pour le suivi et l'organisation des résultats.
Une expérience en analyse bioinformatique n'est pas indispensable, mais des notions dans le traitement de données de séquençage constitueraient un avantage.
Compétences comportementales
• Rigueur expérimentale.
• Sens de l'organisation.
• Autonomie.
• Capacité à travailler en équipe.
• Capacité à rendre compte de l'avancement des expérimentations.
• Esprit critique vis-à-vis des résultats expérimentaux.
• Capacité d'adaptation à différents protocoles et types d'échantillons.
Contraintes et risques :
• Manipulation d’échantillons biologiques d’origine animale.
• Manipulation d’échantillons fécaux susceptibles de contenir différents microorganismes.
• Manipulation de réactifs de biologie moléculaire.
• Travail nécessitant le respect strict des procédures visant à limiter les contaminations entre échantillons et entre étapes pré- et post-PCR.
• Travail en laboratoire de niveau 3*.
• Port des équipements de protection individuelle adaptés aux manipulations réalisées.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 4 Baccalauréat
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Technicienne / Technicien en biologie - SVT
