Technicien-ne en biologie moléculaire : étude des microbes protecteurs de la vigne

Vous serez accueilli(e) au sein de l’équipe ‘Rooti’ (pour Root interactions) de l’UMR ‘Ecophysiologie et Génomique fonctionnelle de la Vigne’ (EGFV) ainsi que dans l’UMR ‘Santé et Agroécologie au Vignoble’ (SAVE) sur le site INRAE de Nouvelle Aquitaine-Bordeaux (Villenave d’Ornon). Les UMR EGFV et SAVE collaborent sur l’étude du microbiome de la vigne et ont pour objectif commun d’identifier les traits de la plante en lien avec les biomarqueurs microbiens de l’état de santé des écosystèmes viticoles.Vous interviendrez dans le programme de recherche PARSADA GetUp, qui a pour objectif de développer des stratégies de biocontrôle du mildiou, basées sur la gestion du microbiote de la vigne (https://getup.inrae.fr/actions-de-recherche), notamment dans les Actions de Recherche AR1 et AR6.Dans l’AR1, l’objectif est d’identifier les microorganismes potentiellement protecteurs vis-à-vis du mildiou de la vigne. Il s’agit plus particulièrement d’analyser les communautés de champignons mycorhiziens à arbuscules, dans des racines de plants prélevés dans des parcelles contrastées en termes de symptômes de mildiou, issues de cinq régions viticoles. L’AR6 concerne l’étude de l’effet du génotype de porte-greffe sur la présence de microorganismes potentiellement protecteurs dans les compartiments racinaires (rhizosphère et racines) et aériens (bois et feuilles). Votre mission sera de participer aux campagnes de prélèvement, et réaliser le traitement et le stockage des échantillons : broyage ou lyophilisation, extraction d’ADN et d’ARN, PCR. Vous serez encadré par un.e ingénieur.e de recherche et travaillerez en interaction avec les personnels et stagiaires impliqués dans ce projet de recherche dans les deux unités de recherche EGFV et SAVE.Vous serez plus particulièrement en charge de :Participer aux campagnes d’échantillonnage ;Gérer le stockage des échantillons et leur préparation ;Extraire les ADN et ARN et réaliser les PCR ;Contribuer à l’organisation du laboratoire de l’équipe d’accueil, participer aux animations et partager vos connaissances et vos compétences ;