Thèse de doctorat sur la diversité et la vulnérabilité des stratégies de recrutement larvaire et de mét

Sujet de thèse :
La plupart des poissons marins présentent un cycle de vie en deux phases : des larves pélagiques dérivantes puis des juvéniles et adultes vivant près des côtes. Le retour des larves vers les côtes puis leur installation et survie dans cet habitat forment le recrutement larvaire. Il s’accompagne de nombreux changements morphologiques, physiologiques et comportementaux contrôlés notamment par les hormones thyroïdiennes : c’est la métamorphose des larves en juvéniles. Cette transition écologique et développementale, cruciale pour le renouvellement des populations, est particulièrement sensible et menacée par le changement climatique et les pollutions.
Les perturbations du système endocrinien constituent un levier majeur par lequel les stress environnementaux - notamment les canicules marines et la pollution chimique - altèrent le développement des organismes marins. Des études pionnières sur quelques espèces de poissons coralliens ont montré qu’une altération de la signalisation thyroïdienne, suite à une exposition à un stress thermique ou chimique, pouvait compromettre les transformations morphologiques, pigmentaires ou comportementales nécessaires à la survie des juvéniles après leur recrutement larvaire. Cependant, ces travaux demeurent limités à un faible nombre d’espèces, majoritairement tropicales, et ne permettent pas d’évaluer la diversité des stratégies de métamorphose et leur vulnérabilité différentielle aux stress environnementaux dans d’autres contextes écologiques, notamment sur le littoral méditerranéen.
Ce sujet de thèse vise à combler cette lacune en adoptant une approche comparative et intégrative sur plusieurs espèces non modèles, notamment méditerranéennes. Ses objectifs sont :
1. Caractériser la diversité des stratégies de métamorphose et de recrutement larvaire, en quantifiant leurs déterminants morphologiques, pigmentaires et comportementaux (analyses quantitatives standardisées et automatisées par imagerie haute résolution, video tracking et deep learning).
2. Analyser la dépendance des stratégies de métamorphose et de recrutement larvaire aux voies endocriniennes contrôlées par les HT, par des approches fonctionnelles combinant dosages et traitements hormonaux, ainsi que des mesures d’expression génique (qPCR et transcriptomique).
3. Évaluer la vulnérabilité des stratégies de métamorphose et de recrutement larvaire (via les biomarqueurs listés précédemment) aux stress chimiques et thermiques (métaux, pesticides, vagues de chaleur), afin d’identifier les mécanismes conduisant à une altération du succès de recrutement larvaire de certaines espèces suite à une exposition à des stress multiples, isolés et combinés (bio-essais écotoxicologiques en milieu contrôlé).
En étudiant comment la diversité des stratégies de recrutement larvaire et métamorphose module la résilience des jeunes poissons face aux pressions anthropiques, cette thèse contribuera à prédire les ef
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