Bio-informaticien-ne pour la génomique des arthropodes vecteurs

Vous rejoindrez une unité de recherche pluridisciplinaire reconnue pour ses travaux en santé animale et en santé publique, menés en lien étroit avec des partenaires académiques et institutionnels. Vous serez accueilli-e au sein d'un collectif de recherche dédié à l'étude des arthropodes vecteurs, réunissant biologistes, écologues et spécialistes des données, travaillant sur des modèles tels que les moustiques, les tiques et les moucherons. La mission s'inscrit dans un contexte de forte croissance des besoins en analyses de données issues de projets de recherche portant sur la dynamique et l'expansion de populations invasives, la compétence vectorielle, ainsi que l'étude des agents pathogènes et des microbiomes associés aux vecteurs. Ces travaux mobilisent des approches de génomique, de génomique des populations, de métagénomique, de métatranscriptomique et de métabarcoding. Ce poste joue un rôle clé dans l'exploitation et la valorisation de jeux de données complexes, produits dans un contexte scientifique exigeant et collaboratif. Il contribue directement à la compréhension des mécanismes biologiques et écologiques impliqués dans les maladies à transmission vectorielle, en appui aux chercheurs et aux projets de l'unité.

Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :

Analyse et traitement de données biologiques

- Concevoir et organiser la collecte, la structuration et le traitement de données issues des sciences du vivant.

- Analyser des jeux de données génomiques et métagénomiques et contribuer à la résolution de problématiques bio-informatiques.

- Développer, adapter et déployer des pipelines et outils de traitement automatisés.

Appui méthodologique et scientifique

- Conseiller les équipes sur le choix des méthodes d'analyse lors du montage et de la conduite des projets scientifiques.

- Contribuer à la rédaction de protocoles, de documentations techniques et de sections spécialisées d'articles scientifiques ou de dossiers de financement.

- Assurer une veille scientifique et technologique et participer au transfert des connaissances au sein de l'unité.

Animation et formation

- Participer à la formation des membres de l'unité aux outils et méthodes bio-informatiques, en lien avec les autres spécialistes des données.

- Contribuer à l'harmonisation des pratiques et à la réflexion collective sur le développement de pipelines mutualisés.