Chercheur-se en deep learning appliqué à l’imagerie des sols
Référence : INRAE-OT-30214
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
- Localisation : Essonne
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Non renseigné
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Vous exercerez votre activité au sein de l'Unité Mixte de Recherche INRAE-AgroParisTech EcoSys (Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes), localisée sur le Campus Agro Paris Saclay, qui est composée de 95 permanents. Nos recherches visent à accompagner la transition agroécologique pour atténuer et s’adapter au changement climatique. Vous travaillerez au sein du pôle Sol&Tox (Science du sol et écotoxicologie terrestre) de l'UMR EcoSys, qui étudie l’effet de l’usages des sols et des pratiques agroécologiques sur la santé des sols et leur multifonctionnalité. Dans ce cadre, nous développons des dispositifs expérimentaux, des techniques d'imagerie et des modèles permettant d'explorer le fonctionnement des sols, à des échelles allant des pores microscopiques à la parcelle et au paysage.
Votre mission consistera à contribuer à un projet scientifique explorant l’effet de la structure 3D microéchelle du sol sur l’accessibilité des matières organiques à la décomposition. Vous appliquerez des techniques de deep learning sur des images 3D issues de tomographie RX afin de classifier les constituants du sol (matrice minérale, porosité, matières organiques).
Vous serez plus particulièrement en charge de :
- la rédaction d’un protocole sur l’utilisation de l’approche de deep learning nnU-Net adapté à nos objectifs de recherche et aux ressources de notre laboratoire ;
- la réutilisation et l’optimisation d’un entraînement de modèle de deep learning récemment développé lors d’un stage M2 dans notre laboratoire pour classifier les constituants du sol ;
- l’application du modèle retenu sur >20 jeux de données de tomographie RX et la vérification des résultats ;
- la préparation d’un manuscrit d’article scientifique sur la contribution du deep learning aux sciences des sols.
Conditions particulières d’activité : Temps de formation limité étant donné la durée courte du contrat. Vous êtes encouragé.e à nous contacter en amont de votre candidature pour toute précision (voir modalités pour postuler)
Profil recherché
Formation recommandée : Niveau Bac+5 Master ou équivalent en sciences de l’environnement, analyse d’images ou SIG
Connaissances souhaitées : Computer vision, machine learning et deep learning (connaissances approfondies), Sciences des sol (connaissances générales), Langue anglaise : B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)
Expérience appréciée : Etudiant.es en sortie de cursus M2 éligibles sans expérience préalable. Expérience d’écriture de code indispensable. Expérience sur l’utilisation du deep learning, en particulier l’approche nnU-Net, sur des images 3D issues de tomographie RX. Expérience souhaitée sur l’utilisation de supercalculateurs (exemple : machine Jean Zay)
Aptitudes recherchées : Sens relationnel (travail en équipe, capacité de reporting), Autonomie, Intérêt pour la recherche, Goût pour la valorisation et la diffusion des résultats et outils développés
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
Qui sommes-nous ?
NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE
Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.
Notre Mission ?
Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.
Pour répondre à ces grands enjeux mondiaux, nous avons besoin de renfort dans nos équipes. Des métiers de la recherche aux métiers de l’appui, l’INRAE recrute à tout niveau de diplôme (du CAP/BEP à Bac+8) !
Rejoignez une communauté engagée et agissez pour l’intérêt général !
À propos de l'offre
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Vacant à partir du 02/11/2026
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Experte / Expert en instrumentation et expérimentation
