Chercheur.se postdoctoral en épidémiologie vétérinaire
Référence : 2026-2301827
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
- Localisation : 69280 Marcy L'Etoile
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels A partir de 37 629,72 € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A+ (Encadrement supérieur - Autres emplois fonctionnels)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Vous serez plus particulièrement en charge de :
- définition et évaluation des indicateurs de santé construits à partir des données de capteurs et de production/reproduction : définir des valeurs de référence (baselines) et caractériser les déviations (anomalies) liées à des événements sanitaires (ex : BVD, infections respiratoires, ou foyers de FCO 3-8 de l'été 2025) à partir des données fournies par les partenaires du projet ;
- simulation de la propagation et de l’impact de maladies infectieuses émergentes : Développer et mettre en œuvre un modèle mécaniste simulant d’une part la transmission de pathogènes au sein et entre élevages, et d’autre part l’impact de ces infections sur les indicateurs d ‘intérêt. Ceci permettra d'évaluer la sensibilité, la spécificité et la précocité des méthodes de détection d'anomalies face à différents scénarios épidémiologiques ;
- intégration des réseaux d'échanges d'animaux : en collaboration avec les partenaires du projet HODAS en charge de l’analyse de ces données, intégrer les processus de transmission entre élevages liés aux mouvements d’animaux aux modèles développés, afin d'identifier les facteurs clés de réussite d'un dispositif de surveillance (maillage des élevages équipés, caractéristiques des épizooties).
Le contrat est prévu pour une durée de 24 mois dans un premier temps, mais pourra être prolongé d’une durée de 9 mois pour prolonger les travaux réalisés dans le cadre du projet HODAS et pour réaliser des travaux similaires sur l’épizootie de dermatose nodulaire contagieuse ayant eu lieu en 2025 en France.
Profil recherché
Formation recommandée : doctorat dans les domaines de l’épidémiologie quantitative ou de l’écologie
Connaissances souhaitées : connaissances en modélisation statistique et maîtrise du langage R
Expérience appréciée : expérience pertinente dans l’analyse de séries temporelles ou de l’utilisation de modèles mécanistes
Aptitudes recherchées : capacité à travailler en équipe et à collaborer avec des chercheurs issus de disciplines variées, incluant les sciences biologiques et sociales ; aptitude à produire et soumettre des publications dans des revues scientifiques ; très bonne maîtrise de l’anglais, à l’oral comme à l’écrit
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Productions animales, élevage spécialisé, aquaculture, soins aux animaux (y compris vétérinaire)
Langues
- Anglais Autonome
Éléments de candidature
Documents à transmettre
Personnes à contacter
Qui sommes-nous ?
NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE
Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.
Notre Mission ?
Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.
Pour répondre à ces grands enjeux mondiaux, nous avons besoin de renfort dans nos équipes. Des métiers de la recherche aux métiers de l’appui, l’INRAE recrute à tout niveau de diplôme (du CAP/BEP à Bac+8) !
Rejoignez une communauté engagée et agissez pour l’intérêt général !
Descriptif du service
Environnement de travail, missions et activités
Vous exercerez votre activité au sein de l’Unité mixte de recherche INRAE-VetAgro Sup EPIA, reconnue pour ses travaux en épidémiologie des maladies animales et zoonotiques, combinant études de terrain et modélisation dans une approche One Health. Vous travaillerez sous la supervision de Thibaut Lurier (EPIA), Aurélien Madouasse (BIOEPAR) et Julie Shapiro (ANSES, Unité EAS). Vous serez basé(e) sur le campus de VetAgro Sup, à Marcy l’Etoile, à proximité de Lyon. Votre mission consistera à conduire des recherches en épidémiologie vétérinaire, sur le thème de la surveillance syndromique. En particulier, vous évaluerez le potentiel de données collectées pour l’élevage de précision (comportements prédits à partir d’accéléromètres placés dans des colliers) et de données de production/reproduction pour la détection précoce d’émergences sanitaires chez les bovins laitier. Ce travail s’inscrit dans le projet HODAS (Leveraging host population data for enhancing surveillance), financé par le PEPR PREZODE. Le poste combinera de la simulation mécaniste de la propagation et des impacts de maladies émergentes et de la modélisation statistique pour la détection précoce d’émergences à partir des données disponibles, par nature hétérogène. Le travail sera effectué en lien étroit avec les partenaires du projet : UMR BIOEPAR (Oniris VetAgroBio, Inrae) et l’Unité EAS (ANSES) UMR EPIA.
À propos de l'offre
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Ces activités nécessiteront une collaboration étroite avec les partenaires du projet HODAS en France (notamment l'unité BIOEPAR à Nantes et l'unité EAS à Lyon) et pourront inclure des déplacements ponctuels pour des réunions de coordination au sein du consortium HODAS.
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Susceptible d'être vacant à partir du 01/09/2026
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Chercheuse / Chercheur
