Développeur.euse bio-informatique
Référence : 2026-2233338
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
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Employeur :
Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
L'Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes. - Localisation : 63122 Saint-Genès-Champanelle
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
- Expérience souhaitée Débutant
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels 26 937,48 € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A+ (Encadrement supérieur - Autres emplois fonctionnels)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Votre mission principale sera de développer une base de connaissances dédiée à la mastication artificielle. Pour cela, vous intégrerez une équipe dynamique et travaillerez en étroite collaboration avec un ingénieur chargé de la conception et du développement de l’instrument, un ingénieur de recherche en bio-informatique de l'équipe ainsi qu’avec une chercheuse spécialiste en physiologie de la mastication. Vous mobiliserez vos compétences en ingénierie logicielle et en structuration des données dans un contexte d’exploitation de données au service de l’expérimentation.
Vous serez plus particulièrement en charge de :
- concevoir un modèle de données intégrant les différentes dimensions des jeux de données déjà collectés (propriétés aliment brut, traits santé bucco-dentaire, propriétés des bols alimentaires) ;
- construire la base de données et l'API correspondante ;
- construire la partie interface permettant l'interrogation et la fouille de la base ;
- choisir, entrainer, implémenter et intégrer un outil de prédiction relatif à la configuration de AM2 ;
- produire les documentations et examen de codes, publier les codes sur dépôt Git du projet ;
- construire les pipelines de CI/CD nécessaires ;
- construction et administration de l'environnement informatique hébergeant la base (Cloud UCA) ;
- formation des futur.e.s utilisateur.trice.s.
Profil recherché
Formation recommandée :
- intérêt pour le développement de logiciels
- motivation pour les dernières technologies web
- connaissance des API REST et des pipelines CI/CD
- connaissance des microservices serait un avantage
Connaissances souhaitées :
- environnement de travail sous Linux, IDE IntelliJ
- Python et Java
- SQL, RDF
- norme API ouverte
- Git et Docker
- qualité du code
- méthodes agiles et Scrum
Expérience appréciée :
- expérience du développement logiciel dans ou en collaboration avec un laboratoire de recherche
- connaissance des API REST et des pipelines CI/CD
- connaissance des microservices serait un avantage
Diplôme minimum requis : Bac+3
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents
- Spécialisation Informatique, traitement de l'information, réseau de transmission des données
Éléments de candidature
Documents à transmettre
Personnes à contacter
Qui sommes-nous ?
NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE
Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.
Notre Mission ?
Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.
Pour répondre à ces grands enjeux mondiaux, nous avons besoin de renfort dans nos équipes. Des métiers de la recherche aux métiers de l’appui, l’INRAE recrute à tout niveau de diplôme (du CAP/BEP à Bac+8) !
Rejoignez une communauté engagée et agissez pour l’intérêt général !
Descriptif du service
Vous intégrerez l’Unité de Nutrition Humaine (environ 150 personnes) et plus spécifiquement l’équipe VaRIAe (15 personnes) dont les objectifs scientifiques sont de décrire, comprendre et prédire la variabilité inter-individuelle du métabolisme et de la réponse à l’alimentation, avec pour finalité l’amélioration de la prévention nutritionnelle des maladies cardiométaboliques et l’accompagnement d’un vieillissement en santé.
Vous serez principalement impliqué.e dans le projet MASTIPROG, financé par Qualiment. Ce projet s’appuie sur un masticateur artificiel (AM2) permettant de générer des bols alimentaires dans des conditions de mastication contrôlées, ensuite caractérisés (granulométrie, biochimie, …) et utilisés dans des essais de digestion in vitro. La programmation de l’AM2 repose sur des données collectées in vivo pour chaque type d’aliment. MASTIPROG a pour objectif de faire évoluer cette méthodologie par la construction d’une base de données alimentée par les essais déjà réalisés et d’une interface permettant de l’interroger. Sur la base d’un corpus de données historiques mis à disposition par l’équipe, un outil de prédiction sera développé pour assister la programmation de l’AM2 afin de produire des bols alimentaires dans différentes conditions orales et pour divers objectifs scientifiques, en réduisant le recours aux essais in vivo ainsi que les coûts et délais associés.
À propos de l'offre
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Le site de Theix situé à Saint-Genès-Champanelle est desservi par la ligne T2C numéro P39 ainsi qu’une ligne de transport à la demande, il est également équipé de stationnements et de services dédiés à la pratique du vélo.
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Susceptible d'être vacant à partir du 01/07/2026
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Experte / Expert en production, traitement et analyse de données
