Doctorant en chimie analytique spécialisé dans l’analyse des protéines par des approches de spectrométr

Sujet de thèse :
Exploiter le mécanisme catalytique de la métalloenzyme IspG en utilisant des outils moléculaires innovants.

L'objectif principal du projet METALICAT vise le développement des approches analytiques basées sur la spectrométrie de masse native couplée à la mobilité ionique de haute résolution (nIM-MS) et l’optimisation des méthodes d’échange hydrogène-deutérium (HDX-MS) afin d’élucider le mécanisme d'inhibition de l’enzyme IspG.
Les activités du doctorant (H/F) sont : - Développer des approches de MS native en injection directe ou en combinaison avec des méthodes LC non dénaturantes
- Optimiser des approches nIM-MS sur différents systèmes de mobilité ionique
- Développer des méthodes de type collision induced unfolding (CIU) pour évaluer la stabilité en phase gazeuse de la protéine IspG lors de son interaction avec différents inhibiteurs.
- Développer de méthodes HDX-MS pour évaluer l'impact des nouveaux inhibiteurs sur la conformation et la dynamique de l'IspG.
- Interprétation bioinformatique des données.
- Suivre des projets et participation aux réunions de collaboration.
- Rédiger des rapports.
- Présenter et diffuser des résultats obtenus dans le cadre du projet.
- Utiliser des instruments de spectrométrie de masse.
- Assurer la traçabilité des analyses dans le cadre de la démarche qualité du LSMBO (environnement ISO 9001).



Contexte :
La thèse sera rattachée à l'Ecole Doctorale des Sciences Chimiques de l'Université de Strasbourg (ED222).

L’Institut Pluridisciplinaire Hubert CURIEN (IPHC), unité mixte de recherche sous cotutelle du CNRS et de l’Université de Strasbourg (UMR7178), est un laboratoire pluridisciplinaire où des équipes de recherche de cultures scientifiques différentes (écologie, physiologie et éthologie, chimie et physique subatomique) développent des programmes de très haut niveau avec pour socle l’instrumentation scientifique. L'IPHC est structuré en 3 départements et comptabilise un effectif total de 393 agents (H/F) dont 257 agents permanents (soit 119 chercheurs et enseignants-chercheurs et 138 ingénieurs et techniciens H/F), 46 agents en CDD et 102 doctorants H/F.

Le doctorant (H/F) rejoindra l'équipe LSMBO (Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique) de l'IPHC composée de 12 chercheurs et enseignants-chercheurs et 9 ingénieurs et techniciens permanents (H/F).

Le doctorant (H/F) interagira au quotidien avec l'ensemble du personnel du LSMBO incluant ingénieurs en spectrométrie de masse, informaticiens et bioinformaticiens. Il ou elle interagira également avec des collaborateurs externes du laboratoire.

Le candidat (H/F) doit être titulaire d'un master et/ou d'un diplôme d'ingénieur. Il ou elle devra justifier de solides connaissances en :
- chimie bio analytique, en spectrométrie de masse et en mobilité ionique
- Connaissances en MS native et en HDX-MS
- Connaissances en LC non dénaturante couplée à la nMS.
- Connaissances sur le déve
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