Doctorant interdisciplinaire en neurosciences et bioinformatique pour l’étude du cerveau et de son envi

Sujet de thèse :
Nos rythmes biologiques sur 24h, réglés par l’environnement, orchestrent le fonctionnement du cerveau, du métabolisme et du comportement. Les modes de vie modernes (pollution lumineuse, travail posté, repas décalés) perturbent ces rythmes circadiens et désynchronisent les horloges internes, avec des effets majeurs sur la santé, encore mal compris au niveau cérébral. Ce projet vise à déterminer comment ces perturbations modifient la dynamique et la coordination des réseaux cérébraux, en les reproduisant expérimentalement chez la souris. Nous suivrons l’activité neuronale de plusieurs régions clés coordonnant les fonctions métaboliques et les comportements. L’analyse intégrée de ces données, notamment par l’intelligence artificielle, permettra d’identifier des signatures de désynchronisation et d’évaluer la capacité de ces réseaux à se resynchroniser après retour à des conditions normales, apportant une compréhension dynamique de l’impact des rythmes de vie modernes sur le cerveau.
Contexte :
La thèse aura lieu à l'Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives (INCI) appartenant à l'Institut des Sciences Biologiques (INSB) du CNRS. L'INCI est situé au coeur du campus de l'esplanade, sur un site verdoyant accessible très facilement en transport en commun. L'équipe d'accueil est l'équipe 7 Régulation et Perturbation des rythmes neuroendocrines. La thèse se fera en co-tutelle avec le laboratoire iCube appartenant à l'Institut des sciences de l'Information et de leurs Interactions (INS2I), dans l'équipe Sciences informatiques: fondements de l'informatique, calculs, algorithmes, représentations, exploitations. L'équipe de l'INCI, spécialisée dans les rythmes circadiens, maîtrise les outils nécessaires aux enregistrements neuronaux et au phénotypage métabolique (photométrie de fibre, chirurgie stéréotaxique, systèmes d'actimétrie et calorimétrie). La thèse sera co-encadrée par Dr Etienne Challet et Dr Clémentine Fillinger. Les expériences seront réalisées au Chronobiotron (UAR3415), dédié à l'étude des rythmes biologiques, avec le soutien du plateau d'analyse de signal in vivo de l'INCI. L'analyse de données multimodales complexes s'appuiera sur la collaboration avec N. Lachiche (ICube), spécialiste en apprentissage automatique et données temporelles. Le projet fournira des données longitudinales complexes pour la validation de ces modèles, créant une synergie forte entre neurosciences et science des données.