Etude du rôle du cuivre dans l'interaction plante-nématodes à galles H/F

Missions :
L'ingénieur.e recruté.e mettra en œuvre une approche d’imagerie par fluorescence X couplée à la microscopie électronique à transmission (TEM EDX) afin d'identifier les cellules dans lesquelles le cuivre est localisé au sein des galles formées par des nématodes qui parasitent les plantes de culture. Cette approche permettra de superposer la localisation des métaux à l'ultrastructure de la galle à haute résolution spatiale et ainsi de mieux comprendre l'importance du cuivre dans l’infection par les nématodes à galles.
Activités :
L'ingénieur.e recruté.e mettra en œuvre une approche d’imagerie par fluorescence X couplée à la microscopie électronique à transmission (TEM EDX):
- collecte et fixation des échantillons de galle et de racine
- préparation des échantillons pour la microscopie électronique à transmission : inclusion en résine et coup à l’ultramicrotome.
- acquisition des données TEM et EDX
- analyse des données, quantification et validation statistique.
- mise en forme et présentation des données lors des réunions avec les collaborateurs du projet ANR.

Contexte de travail :
Les nématodes à galles (Root Knot Nematodes RKN) sont des vers microscopiques qui parasitent les racines des plantes et constituent l'un des ravageurs des cultures les plus importants au monde. Ces ravageurs infectent plus de 5 000 espèces végétales, dont la plupart des plantes de culture. Chaque année, les nématodes à galles sont responsables de plus de 10 milliards de dollars de pertes agricoles à l'échelle mondiale. Une fois à l'intérieur de la racine, les nématodes à galles induisent la dédifférenciation des cellules de la racine pour former le site nourricier des nématodes. La formation du site nourricier conduit à l'apparition de galles racinaires, qui constituent le symptôme caractéristique de l'infection par les nématodes à galles. Des travaux récents ont révélé que les galles déclenchent une réponse à la privation en cuivre. De plus, des plantes arrosées avec du cuivre présentent une sensibilité réduite à l'infection par les nématodes à galles. Dans le cadre du projet CROWN financé par l’Agence Nationale de la Recherche nous avons montré que l'infection par les nématodes à galles est associée à une diminution du cuivre dans les cellules des galles. L'imagerie par fluorescence X a révélé un patron spécifique de localisation du cuivre et du fer dans les galles. Le travail de l’IR recruté s’inscrira dans la poursuite de ces travaux.
L'ingénieur.e recruté.e travaillera dans l'équipe "Approches intégrées du transport ionique" qui fait partie du département de biologie cellulaire de l'Institut de biologie intégrative de la cellule (I2BC ; https://www.i2bc.paris-saclay.fr/spip.php?article312&lang=en) sur campus de recherche de Gif-sur-Yvette. Le projet sera mené en étroite collaboration avec la plateforme d’imagerie de Gif-sur-Yvette qui dispose d’un microscope équipé pour le TEM EDX (https://www.i2bc.
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