H/F- Ingénieur de recherche en Ingéniérie logicielle au sein d'IMGT

Missions :
Responsable de gestion du flux d'information, de la biocuration en immunogénétique ainsi que de la qualité. Maintenance d’outils et transfert de technologie du laboratoire en startup/deeptech
Activités :
Activité 1 :
o Gestion du flux d'information des données, traitement informatique et expertise biologique des séquences nucléotidiques en immunogénétique pour le système d'information IMGT.
o Réceptionner les données des séquences nucléotidiques des immunoglobulines et des récepteurs des cellules T
o Utiliser des scripts et des procédures stockées en Java, Python, Rust et en PHP
Activité 2 :
o Interroger les bases de données avec des requêtes SQL.
o Intégrer les données dans la base de données LIGM-DB
o Distribuer les données à analyser aux collègues en biocuration
o Contrôler la qualité des données avant intégration dans les bases de données.
o Adaptation aux nouvelles architectures et technologies mis en place par le service informatique de l’équipe.
o Collaborer avec le service bioinformatique dans les études de conception et d'évolution des outils et bases de données du système de la modélisation jusqu'à validation finale.
o Rédiger la documentation du pipeline et workflow des différentes procédures appliquées.
Activité 3 :
o Concevoir, analyse, maintien, évolution et test des outils de la biocuration.
o Rediger et mettre à niveau les documentations techniques et fonctionnelles.
o Modeliser, concevoir et/ou paramétrer tout ou partie de la solution logicielle
o Developper et tester les objets et composants, les logiciels.
o Assurer la maintenance évolutive et curative des développements réalisés
o Elaborer la stratégie de test, concevoir, spécifier et exécuter des tests fonctionnels et/ou techniques
o Creer et tester les packages applicatifs et les scripts de déploiement en production
o Réceptionner, installer, documenter, mettre à disposition les packages en assurant le suivi des versions
Activité 4 :
o Contribuer à la mise en place du système de management qualité selon les normes ISO 9001 et NFX-50-00
o Piloter le processus Infrastructure qualité du laboratoire.
o Participer à la gestion du parc informatique et à la résolution des incidents.
o Organiser les réunions des différents processus mis en place dans le cadre de la démarche qualité.
o Mettre en place des indicateurs en relation avec la stratégie scientifique et politique du laboratoire et les suivre.
Activité 5 :
o Maintenir, gérer et améliorer les bases de données de l’IMGT.
o Participer à la gestion des infrastructures et au déploiement des logiciels.
o Participation à l’administration des serveurs, à la gestion des données et des permissions.
Activité 6 :
o Accroître la visibilité des projets de la biocuration.
o Présenter les travaux de biocuration en interne et en externe en réalisant des posters, rédigeant des résumés pour les congrès nationaux et internationaux de biocuration.
o Présenter et valoriser l’ima
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